EWSR1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
EWSR1基因编码一种多功能RNA结合蛋白,参与转录调控、RNA加工和DNA损伤修复,其基因重排与多种软组织肿瘤密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | EWSR1 |
|---|---|
| 基因全名 | EWSR1 RNA Binding Protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q12.2 |
| NCBI Gene ID | 2130 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2130 |
| Ensembl ID | ENSG00000182944 |
| UniProt ID | Q01844 |
| OMIM ID | 133450 |
| HGNC ID | 3508 |
| 基因别名 | EWS, EWSR1, bK984G1.4 |
基因功能与研究简介
EWSR1基因编码一种多功能RNA结合蛋白,属于TET家族(TLS/FUS, EWSR1, TAF15)。该蛋白参与多种细胞过程,包括转录调控、RNA加工、DNA损伤修复和细胞信号转导。EWSR1蛋白包含一个N端转录激活结构域和一个C端RNA识别基序。EWSR1基因的染色体易位导致其与多种转录因子融合,产生致癌融合蛋白,是尤文肉瘤、促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤等软组织肿瘤的分子标志。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 尤文肉瘤 | EWSR1基因与FLI1等ETS转录因子基因发生染色体易位,形成EWSR1-FLI1融合基因,编码异常转录因子,驱动肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤 | EWSR1与WT1基因融合,形成EWSR1-WT1融合蛋白,参与肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 血管瘤样纤维组织细胞瘤 | EWSR1与ATF1或CREB1基因融合,导致异常转录激活。 | 已明确致病 |
| 软组织透明细胞肉瘤 | EWSR1与ATF1或CREB1基因融合,驱动肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 黏液样脂肪肉瘤 | EWSR1与DDIT3基因融合,形成EWSR1-DDIT3融合蛋白。 | 已明确致病 |
| 黑色素瘤 | EWSR1基因重排在部分黑色素瘤中检测到,但具体作用尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| A673 | 暂无可靠数据 | 尤文肉瘤细胞系,表达EWSR1-FLI1 |
| SK-N-MC | 暂无可靠数据 | 尤文肉瘤细胞系,表达EWSR1-FLI1 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| EWSR1-FLI1融合 | 染色体易位 | 约85%的尤文肉瘤 | Gain of Function |
| EWSR1-WT1融合 | 染色体易位 | 促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤 | Gain of Function |
| EWSR1-ATF1融合 | 染色体易位 | 血管瘤样纤维组织细胞瘤、软组织透明细胞肉瘤 | Gain of Function |
| EWSR1-CREB1融合 | 染色体易位 | 血管瘤样纤维组织细胞瘤、软组织透明细胞肉瘤 | Gain of Function |
| EWSR1-DDIT3融合 | 染色体易位 | 黏液样脂肪肉瘤 | Gain of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明EWSR1基因的失功能突变导致疾病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
EWSR1融合蛋白通常获得异常转录激活功能,驱动肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分EWSR1融合蛋白可能干扰野生型EWSR1功能,但具体机制尚不明确。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003676 (核酸结合) | • GO:0003723 (RNA结合) |
| • GO:0005634 (细胞核) | • GO:0005654 (核浆) |
| • GO:0005737 (细胞质) | • GO:0006351 (转录,DNA模板) |
| • GO:0006355 (转录调控,DNA模板) | • GO:0006281 (DNA修复) |
| • GO:0006397 (mRNA加工) | • GO:0008380 (RNA剪接) |
相关通路
• hsa05200 (癌症通路)
• hsa05202 (转录失调在癌症中)
• hsa03040 (剪接体)
蛋白质功能简介
EWSR1蛋白是一种多功能RNA结合蛋白,包含N端转录激活结构域(富含谷氨酰胺、丝氨酸和酪氨酸)和C端RNA识别基序。它参与转录调控、RNA加工、DNA损伤修复和细胞信号转导。在尤文肉瘤等肿瘤中,EWSR1基因与ETS转录因子基因(如FLI1)融合,产生致癌融合蛋白,这些融合蛋白通过异常转录激活驱动肿瘤发生。