EXD2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

EXD2(3'-5'外切酶结构域2)是一种参与DNA双链断裂修复和线粒体基因组维护的关键蛋白,其功能异常与神经发育障碍和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 EXD2
基因全名 3'-5' exonuclease domain containing 2
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 14q12
NCBI Gene ID 55218 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55218
Ensembl ID ENSG00000100823
UniProt ID Q9H2H9
OMIM ID 617367
HGNC ID 25362
基因别名 C14orf114, EXDL2, FLJ10948

基因功能与研究简介

EXD2(3'-5'外切酶结构域2)基因编码一种具有3'-5'外切酶活性的蛋白,参与DNA双链断裂修复(特别是同源重组修复)和线粒体基因组维护。该蛋白定位于细胞核和线粒体,通过其外切酶活性处理DNA末端,促进修复过程。EXD2功能缺失与神经发育障碍(如小头畸形、智力障碍)和某些癌症(如乳腺癌、卵巢癌)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
小头畸形、智力障碍 EXD2纯合或复合杂合突变导致蛋白功能丧失,影响DNA修复和神经发育,已明确致病。 ClinVar, OMIM
乳腺癌 EXD2表达下调或突变可能增加乳腺癌风险,具有较强研究证据。 COSMIC, PubMed
卵巢癌 EXD2突变或表达异常与卵巢癌发生相关,具有较强研究证据。 COSMIC, PubMed
其他癌症 EXD2在多种肿瘤中表达异常,可能作为潜在肿瘤抑制因子,但证据尚不充分。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1045C>T (p.Arg349Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
c.1480G>A (p.Gly494Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或活性
c.1234del (p.Leu412TrpfsTer3) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失型):无义突变、移码突变等导致蛋白截短或降解,丧失外切酶活性,影响DNA修复和线粒体维护。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型):目前暂无明确证据表明EXD2存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负效):目前暂无明确证据表明EXD2突变具有显性负效作用。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004527 (exonuclease activity) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0005739 (mitochondrion) • GO:0006281 (DNA repair)
• GO:0006310 (homologous recombination)

相关通路

Homologous recombination repair (GO:0000724)
Mitochondrial DNA maintenance (GO:0000002)

蛋白质功能简介

EXD2蛋白包含一个3'-5'外切酶结构域,定位于细胞核和线粒体。在细胞核中,它参与同源重组修复,通过切除DNA末端产生3'单链DNA,促进修复过程。在线粒体中,它参与线粒体DNA的复制和维护。EXD2功能缺失会导致DNA修复缺陷和线粒体功能障碍,进而引发神经发育异常和增加癌症风险。

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