EXO1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
EXO1基因编码核酸外切酶1,在DNA复制、重组和错配修复中发挥关键作用,其突变与多种癌症及遗传性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | EXO1 |
|---|---|
| 基因全名 | exonuclease 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q43 |
| NCBI Gene ID | 9156 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9156 |
| Ensembl ID | ENSG00000174371 |
| UniProt ID | Q9UQ84 |
| OMIM ID | 606063 |
| HGNC ID | 3512 |
| 基因别名 | HEX1, hExoI |
基因功能与研究简介
EXO1基因编码核酸外切酶1,属于Rad2/XPG家族,具有5'→3'核酸外切酶和RNase H活性。该蛋白在DNA复制、重组、错配修复和端粒维持中发挥关键作用。EXO1通过与MLH1、MSH2等错配修复蛋白相互作用,参与DNA损伤修复过程。其功能缺陷与基因组不稳定性和多种癌症易感性相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 遗传性非息肉病性结直肠癌(Lynch syndrome) | EXO1突变导致错配修复功能缺陷,增加微卫星不稳定性,与Lynch综合征相关。 | 已明确致病 |
| 子宫内膜癌 | EXO1突变或表达异常与子宫内膜癌的发生发展相关。 | 具有较强研究证据 |
| 卵巢癌 | EXO1表达异常与卵巢癌的预后相关。 | 具有较强研究证据 |
| 胃癌 | EXO1多态性与胃癌易感性相关。 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | EXO1表达水平与乳腺癌的进展和预后相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1765A>G (p.Lys589Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.2045C>T (p.Pro682Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.2576G>A (p.Arg859Gln) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.2926C>T (p.Arg976Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致EXO1蛋白功能丧失或活性降低,影响DNA修复,增加基因组不稳定性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明EXO1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明EXO1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • DNA binding (GO:0003677) | • exonuclease activity (GO:0004527) |
| • 5'-3' exonuclease activity (GO:0008408) | • DNA repair (GO:0006281) |
| • mismatch repair (GO:0006298) | • DNA recombination (GO:0006310) |
| • nucleus (GO:0005634) |
相关通路
• Mismatch Repair (MMR) pathway (hsa03430)
• Homologous recombination (hsa03440)
• Base excision repair (hsa03410)
蛋白质功能简介
EXO1蛋白由846个氨基酸组成,分子量约94 kDa。其N端具有核酸外切酶结构域,C端包含与MLH1和MSH2相互作用的区域。EXO1在DNA错配修复中作为5'端切割酶,参与切除含错配的DNA片段。此外,EXO1还参与DNA双链断裂的末端切除,促进同源重组修复。
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