FAM13B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

FAM13B基因编码一个参与细胞信号转导和细胞骨架调控的蛋白,与慢性阻塞性肺疾病和肺癌等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 FAM13B
基因全名 family with sequence similarity 13 member B
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.2
NCBI Gene ID 51306 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51306
Ensembl ID ENSG00000113520
UniProt ID Q9H7L9
OMIM ID 610909
HGNC ID 19367
基因别名 KIAA0913, C5orf5

基因功能与研究简介

FAM13B(family with sequence similarity 13 member B)基因编码一个含有RhoGAP结构域的蛋白,参与细胞信号转导和细胞骨架调控。该基因在肺组织中高表达,与慢性阻塞性肺疾病(COPD)和肺癌的易感性相关。FAM13B可能通过调节Rho GTPase信号通路影响细胞增殖、凋亡和迁移。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
慢性阻塞性肺疾病 FAM13B基因多态性与COPD易感性相关,可能通过影响肺功能和组织重塑参与疾病发生。 GWAS研究,PMID: 21909107
肺癌 FAM13B在肺癌中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡影响肿瘤发生发展。 表达分析和功能研究,PMID: 25605243
肺功能 FAM13B变异与肺功能下降相关,可能影响气道重塑。 遗传关联研究,PMID: 21909107

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
气管 暂无可靠数据 中等表达
乳腺 暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
BEAS-2B 暂无可靠数据 正常支气管上皮细胞
H1299 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs7671167 SNP 风险等位基因频率约0.3 与COPD风险增加相关
rs2869967 SNP 风险等位基因频率约0.2 与肺功能下降相关
rs1903003 SNP 风险等位基因频率约0.4 与COPD易感性相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005096 - GTPase activator activity • GO:0005737 - cytoplasm
• GO:0005829 - cytosol • GO:0007165 - signal transduction
• GO:0030036 - actin cytoskeleton organization

相关通路

Rho GTPase signaling pathway (Reactome: R-HSA-194840)
Signaling by Rho GTPases (Reactome: R-HSA-194315)

蛋白质功能简介

FAM13B蛋白含有RhoGAP结构域,可能作为GTPase激活蛋白参与Rho GTPase信号通路的负调控。该蛋白在肺组织中高表达,可能参与细胞骨架重塑和细胞迁移。研究表明FAM13B在COPD和肺癌中发挥重要作用,但其具体分子机制仍需进一步研究。

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