FAM20C基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

FAM20C是一种分泌型激酶,磷酸化多种分泌蛋白,参与生物矿化、细胞外基质调控及肿瘤发生。

基因信息卡

基因符号 FAM20C
基因全名 FAM20C, golgi associated secretory pathway kinase
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 7p22.3
NCBI Gene ID 56975 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56975
Ensembl ID ENSG00000106344
UniProt ID Q8IXL6
OMIM ID 611061
HGNC ID 22140
基因别名 DMP4, GEF-CK, SCP-1

基因功能与研究简介

FAM20C(FAM20C, golgi associated secretory pathway kinase)是一种分泌型激酶,属于FAM20家族。它主要定位于高尔基体,磷酸化多种分泌蛋白和细胞外基质蛋白,包括小整合素结合配体N端连接糖蛋白(SIBLINGs)家族成员,如骨桥蛋白(OPN)、牙本质涎磷蛋白(DSPP)等。FAM20C在生物矿化、骨和牙本质形成、细胞外基质调控以及肿瘤发生中发挥重要作用。FAM20C突变可导致Raine综合征,一种以骨硬化为特征的遗传性疾病。此外,FAM20C在多种癌症中异常表达,与肿瘤进展和转移相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Raine综合征 FAM20C功能缺失突变导致骨硬化、颅面畸形等,机制涉及磷酸化底物减少,影响生物矿化。 已明确致病
骨发育异常 FAM20C突变影响骨和牙本质形成,导致骨密度异常。 较强研究证据
癌症 FAM20C在多种肿瘤中表达异常,可能通过磷酸化底物影响肿瘤微环境和转移。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
牙本质 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
成骨细胞 暂无可靠数据 高表达
成牙本质细胞 暂无可靠数据 高表达
肝癌细胞系 暂无可靠数据 中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
p.R408W 错义突变 罕见 可能影响激酶活性,导致功能丧失
p.D451N 错义突变 罕见 可能影响底物结合,导致功能丧失
p.R576W 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性,导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

FAM20C功能缺失突变导致激酶活性降低或丧失,影响底物磷酸化,导致Raine综合征等疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明FAM20C存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明FAM20C存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity) • GO:0005524 (ATP binding)
• GO:0005794 (Golgi apparatus) • GO:0005576 (extracellular region)
• GO:0006468 (protein phosphorylation) • GO:0030282 (bone mineralization)

相关通路

hsa04550 (Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells)
hsa04974 (Protein digestion and absorption)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

FAM20C是一种分泌型激酶,属于FAM20家族。它主要定位于高尔基体,磷酸化多种分泌蛋白和细胞外基质蛋白,包括SIBLINGs家族成员。FAM20C在生物矿化、骨和牙本质形成中起关键作用。此外,FAM20C还参与细胞外基质调控和肿瘤发生。FAM20C突变可导致Raine综合征,一种以骨硬化为特征的遗传性疾病。

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