FAP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
FAP(成纤维细胞活化蛋白)是一种II型跨膜丝氨酸蛋白酶,在肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞中高表达,参与细胞外基质重塑和肿瘤进展,是癌症诊断和治疗的潜在靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | FAP |
|---|---|
| 基因全名 | Fibroblast Activation Protein Alpha |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q24.2 |
| NCBI Gene ID | 2191 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2191 |
| Ensembl ID | ENSG00000078098 |
| UniProt ID | Q12884 |
| OMIM ID | 600403 |
| HGNC ID | 3590 |
| 基因别名 | FAPalpha, Seprase, DPPIV-related serine protease |
基因功能与研究简介
FAP基因编码成纤维细胞活化蛋白(FAP),是一种II型跨膜丝氨酸蛋白酶,属于脯氨酰寡肽酶家族。FAP在胚胎发育期间短暂表达,在正常成人组织中表达水平极低,但在多种上皮性肿瘤的基质成纤维细胞(癌症相关成纤维细胞,CAFs)中高表达。FAP具有二肽基肽酶和内肽酶活性,能够降解明胶和I型胶原,参与细胞外基质重塑,促进肿瘤侵袭和转移。此外,FAP还参与免疫调节,可能通过影响肿瘤微环境中的免疫细胞功能来促进免疫逃逸。因此,FAP已成为癌症诊断和治疗的潜在靶点,相关抑制剂和抗体正在研发中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 多种实体瘤(如结直肠癌、乳腺癌、肺癌等) | FAP在肿瘤基质成纤维细胞中高表达,通过降解细胞外基质和调节免疫微环境促进肿瘤进展。 | 具有较强研究证据 |
| 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | FAP是CAFs的标志物,参与肿瘤微环境重塑。 | 具有较强研究证据 |
| 动脉粥样硬化 | FAP在动脉粥样硬化斑块中表达,可能参与斑块进展。 | 潜在关联 |
| 肺纤维化 | FAP在肺纤维化组织中表达上调,可能参与纤维化过程。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脂肪组织 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HT-1080(纤维肉瘤细胞系) | 暂无可靠数据 | FAP表达阳性 |
| U87(胶质母细胞瘤细胞系) | 暂无可靠数据 | FAP表达阳性 |
| MDA-MB-231(乳腺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | FAP表达阳性 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234G>A (p.Gly412Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或酶活性,但功能影响尚未明确 |
| c.1567C>T (p.Arg523Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,但功能影响尚未明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明FAP的致病性突变导致功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明FAP的致病性突变导致功能获得。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明FAP的致病性突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity) | • GO:0008239 (dipeptidyl-peptidase activity) |
| • GO:0005576 (extracellular region) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0030574 (collagen catabolic process) |
相关通路
• Extracellular matrix organization (Reactome: R-HSA-1474244)
• Degradation of the extracellular matrix (Reactome: R-HSA-1474228)
蛋白质功能简介
FAP蛋白是一种II型跨膜丝氨酸蛋白酶,由760个氨基酸组成,包含胞内短尾、跨膜区和胞外催化域。FAP以同源二聚体形式存在,具有二肽基肽酶和内肽酶活性,能够切割底物中的脯氨酸-X键。FAP在肿瘤微环境中的CAFs中高表达,通过降解细胞外基质(如明胶和I型胶原)促进肿瘤细胞侵袭和转移。此外,FAP还参与免疫调节,可能通过影响T细胞功能来促进免疫逃逸。因此,FAP已成为癌症诊断和治疗的潜在靶点,相关抑制剂和抗体正在研发中。
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