FAP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

FAP(成纤维细胞活化蛋白)是一种II型跨膜丝氨酸蛋白酶,在肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞中高表达,参与细胞外基质重塑和肿瘤进展,是癌症诊断和治疗的潜在靶点。

基因信息卡

基因符号 FAP
基因全名 Fibroblast Activation Protein Alpha
基因类型 protein-coding
染色体位置 2q24.2
NCBI Gene ID 2191 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2191
Ensembl ID ENSG00000078098
UniProt ID Q12884
OMIM ID 600403
HGNC ID 3590
基因别名 FAPalpha, Seprase, DPPIV-related serine protease

基因功能与研究简介

FAP基因编码成纤维细胞活化蛋白(FAP),是一种II型跨膜丝氨酸蛋白酶,属于脯氨酰寡肽酶家族。FAP在胚胎发育期间短暂表达,在正常成人组织中表达水平极低,但在多种上皮性肿瘤的基质成纤维细胞(癌症相关成纤维细胞,CAFs)中高表达。FAP具有二肽基肽酶和内肽酶活性,能够降解明胶和I型胶原,参与细胞外基质重塑,促进肿瘤侵袭和转移。此外,FAP还参与免疫调节,可能通过影响肿瘤微环境中的免疫细胞功能来促进免疫逃逸。因此,FAP已成为癌症诊断和治疗的潜在靶点,相关抑制剂和抗体正在研发中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
多种实体瘤(如结直肠癌、乳腺癌、肺癌等) FAP在肿瘤基质成纤维细胞中高表达,通过降解细胞外基质和调节免疫微环境促进肿瘤进展。 具有较强研究证据
癌症相关成纤维细胞(CAFs) FAP是CAFs的标志物,参与肿瘤微环境重塑。 具有较强研究证据
动脉粥样硬化 FAP在动脉粥样硬化斑块中表达,可能参与斑块进展。 潜在关联
肺纤维化 FAP在肺纤维化组织中表达上调,可能参与纤维化过程。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脂肪组织 暂无可靠数据 暂无可靠数据
胰腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HT-1080(纤维肉瘤细胞系) 暂无可靠数据 FAP表达阳性
U87(胶质母细胞瘤细胞系) 暂无可靠数据 FAP表达阳性
MDA-MB-231(乳腺癌细胞系) 暂无可靠数据 FAP表达阳性
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234G>A (p.Gly412Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或酶活性,但功能影响尚未明确
c.1567C>T (p.Arg523Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,但功能影响尚未明确
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明FAP的致病性突变导致功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明FAP的致病性突变导致功能获得。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明FAP的致病性突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity) • GO:0008239 (dipeptidyl-peptidase activity)
• GO:0005576 (extracellular region) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0007155 (cell adhesion) • GO:0030574 (collagen catabolic process)

相关通路

Extracellular matrix organization (Reactome: R-HSA-1474244)
Degradation of the extracellular matrix (Reactome: R-HSA-1474228)

蛋白质功能简介

FAP蛋白是一种II型跨膜丝氨酸蛋白酶,由760个氨基酸组成,包含胞内短尾、跨膜区和胞外催化域。FAP以同源二聚体形式存在,具有二肽基肽酶和内肽酶活性,能够切割底物中的脯氨酸-X键。FAP在肿瘤微环境中的CAFs中高表达,通过降解细胞外基质(如明胶和I型胶原)促进肿瘤细胞侵袭和转移。此外,FAP还参与免疫调节,可能通过影响T细胞功能来促进免疫逃逸。因此,FAP已成为癌症诊断和治疗的潜在靶点,相关抑制剂和抗体正在研发中。

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