FARS2基因|线粒体苯丙氨酰-tRNA合成酶功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

FARS2基因编码线粒体苯丙氨酰-tRNA合成酶,其突变可导致多种线粒体疾病,是神经代谢领域的重要研究靶点。

基因信息卡

基因符号 FARS2
基因全名 phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial
基因类型 protein-coding
染色体位置 6p25.1
NCBI Gene ID 10616 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10616
Ensembl ID ENSG00000145990
UniProt ID O95363
OMIM ID 611592
HGNC ID 21062
基因别名 FARS1, FARS2, HSPC320, mtPheRS

基因功能与研究简介

FARS2基因编码线粒体苯丙氨酰-tRNA合成酶(mtPheRS),该酶负责将苯丙氨酸连接到线粒体tRNA(Phe)上,是线粒体蛋白质合成的重要环节。FARS2基因突变可导致线粒体功能障碍,进而引发一系列疾病,如脑白质病、癫痫、发育迟缓等。FARS2基因的突变类型多样,包括错义突变、无义突变、剪接位点突变等,其功能影响通常为功能缺失(Loss of Function)。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
遗传性痉挛性截瘫 FARS2基因突变导致线粒体功能障碍,影响神经细胞能量供应,导致轴突变性。 ClinVar, OMIM
脑白质病 FARS2突变导致线粒体蛋白合成缺陷,影响髓鞘形成和维持。 ClinVar, OMIM
癫痫 FARS2突变导致线粒体能量代谢异常,影响神经元兴奋性。 ClinVar
发育迟缓 FARS2突变影响大脑发育,导致智力障碍和运动发育迟缓。 ClinVar

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.986G>A (p.Arg329His) 错义突变 罕见 可能影响酶活性,导致功能缺失
c.1174C>T (p.Arg392Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性,导致功能缺失
c.431C>T (p.Pro144Leu) 错义突变 罕见 可能影响催化活性,导致功能缺失
c.1A>G (p.Met1Val) 起始密码子突变 罕见 可能导致蛋白翻译起始失败,功能缺失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数FARS2突变导致酶活性降低或蛋白稳定性下降,从而引起线粒体蛋白合成缺陷,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明FARS2突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明FARS2突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000166 nucleotide binding • GO:0004826 phenylalanine-tRNA ligase activity
• GO:0005739 mitochondrion • GO:0006418 tRNA aminoacylation for protein translation
• GO:0006432 phenylalanyl-tRNA aminoacylation

相关通路

Mitochondrial tRNA aminoacylation (Reactome: R-HSA-379716)
Mitochondrial translation (Reactome: R-HSA-5368287)

蛋白质功能简介

FARS2蛋白(UniProt O95363)是线粒体苯丙氨酰-tRNA合成酶,由451个氨基酸组成,定位于线粒体基质。该蛋白包含催化结构域和反密码子结合结构域,负责将苯丙氨酸特异性地连接到线粒体tRNA(Phe)上。FARS2蛋白的突变会导致线粒体蛋白合成障碍,影响呼吸链复合物的组装,进而导致能量代谢缺陷。

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