FAT1基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
FAT1基因编码一种非典型钙粘蛋白，参与细胞极性、迁移和信号调控，其突变与多种癌症及发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | FAT1 |
|---|---|
| 基因全名 | FAT atypical cadherin 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 4q35.2 |
| NCBI Gene ID | 2195 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2195 |
| Ensembl ID | ENSG00000083857 |
| UniProt ID | Q14517 |
| OMIM ID | 600976 |
| HGNC ID | 3595 |
| 基因别名 | CDHF7, FAT, hFat1, MEGF1 |
基因功能与研究简介
FAT1基因编码一种非典型钙粘蛋白，属于钙粘蛋白超家族。该蛋白包含多个钙粘蛋白重复结构域、EGF样结构域和层粘连蛋白G结构域，参与细胞极性、细胞迁移、细胞增殖和凋亡等过程的调控。FAT1通过调控Hippo信号通路和Wnt信号通路，影响细胞接触抑制和器官大小控制。FAT1突变或表达异常与多种癌症（如胶质母细胞瘤、结直肠癌、肝癌等）以及某些发育性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 胶质母细胞瘤 | FAT1突变导致Hippo信号通路失调，促进肿瘤细胞增殖和侵袭 | 已明确致病 |
| 结直肠癌 | FAT1表达下调或突变与肿瘤进展和不良预后相关 | 具有较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | FAT1突变或缺失导致细胞极性丧失和肿瘤发生 | 具有较强研究证据 |
| 多发性骨髓瘤 | FAT1突变可能参与疾病发生，但具体机制尚不明确 | 潜在关联 |
| 肾母细胞瘤 | FAT1突变与肾母细胞瘤的发生相关 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| U87MG（胶质母细胞瘤细胞系） | 暂无可靠数据 | FAT1表达可能异常 |
| HCT116（结直肠癌细胞系） | 暂无可靠数据 | FAT1表达可能下调 |
| HepG2（肝癌细胞系） | 暂无可靠数据 | FAT1表达可能异常 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function，导致蛋白截短，功能丧失 |
| c.4567_4568insA (p.Thr1523AsnfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function，导致蛋白截短，功能丧失 |
| c.7890G>A (p.Trp2630Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function，导致蛋白截短，功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
Loss of Function（功能丧失型）：FAT1突变导致蛋白功能丧失，常见于无义突变、移码突变等，导致Hippo信号通路失调，促进肿瘤发生。
Gain of Function（功能获得，GOF）
Gain of Function（功能获得型）：目前暂无明确证据表明FAT1存在功能获得型突变。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
Dominant Negative（显性负性效应）：目前暂无明确证据表明FAT1突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) | • GO:0007165 (signal transduction) |
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0035329 (hippo signaling) |
相关通路
• Hippo signaling pathway (KEGG: hsa04390)
• Wnt signaling pathway (KEGG: hsa04310)
蛋白质功能简介
FAT1蛋白是一种非典型钙粘蛋白，包含34个钙粘蛋白重复结构域、5个EGF样结构域和2个层粘连蛋白G结构域。它作为跨膜受体，参与细胞间相互作用和信号转导。FAT1通过其胞内域与β-catenin相互作用，调节Hippo信号通路，影响细胞增殖和凋亡。FAT1的异常表达或突变与多种癌症的发生发展密切相关。
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