FRK基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
FRK(FYN相关激酶)是一种非受体酪氨酸激酶,参与细胞增殖、凋亡和肿瘤抑制,在多种癌症中表达异常。
基因信息卡
| 基因符号 | FRK |
|---|---|
| 基因全名 | FYN related kinase |
| 基因类型 | protein-coding gene |
| 染色体位置 | 6q22.1 |
| NCBI Gene ID | 2444 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2444 |
| Ensembl ID | ENSG00000111816 |
| UniProt ID | P42685 |
| OMIM ID | 606573 |
| HGNC ID | 3955 |
| 基因别名 | PTK5, RAK |
基因功能与研究简介
FRK(FYN related kinase)是一种非受体酪氨酸激酶,属于SRC家族激酶。FRK在多种组织中表达,参与细胞增殖、分化、凋亡和迁移等过程的调控。研究表明FRK在多种肿瘤中表达下调,发挥肿瘤抑制作用。FRK的异常表达与乳腺癌、肝癌、结直肠癌等多种癌症的发生发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | FRK在乳腺癌中表达下调,可能通过抑制细胞增殖和迁移发挥抑癌作用。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | FRK在肝癌中表达降低,与肿瘤侵袭和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | FRK表达下调与结直肠癌的进展和转移相关。 | 研究证据 |
| 胶质母细胞瘤 | FRK在胶质母细胞瘤中表达异常,可能影响肿瘤细胞凋亡。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1000C>T (p.Arg334Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响激酶活性。 |
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响激酶活性,功能未知。 |
| c.789_790insA (p.Gly264fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短。 |
| c.456C>A (p.Asn152Lys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性。 |
| c.234G>T (p.Trp78Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构。 |
| c.1111G>A (p.Glu371Lys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响激酶活性。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):导致FRK蛋白活性降低或丧失,可能削弱其肿瘤抑制作用。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明FRK存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明FRK存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004713 (protein tyrosine kinase activity) | • GO:0005524 (ATP binding) |
| • GO:0006468 (protein phosphorylation) | • GO:0007169 (transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway) |
| • GO:0008284 (positive regulation of cell population proliferation) | • GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• MAPK signaling pathway (hsa04010)
• ErbB signaling pathway (hsa04012)
• Focal adhesion (hsa04510)
• Regulation of actin cytoskeleton (hsa04810)
蛋白质功能简介
FRK蛋白是一种非受体酪氨酸激酶,属于SRC家族。它包含SH2、SH3和酪氨酸激酶结构域。FRK在多种组织中表达,参与细胞信号转导,调控细胞增殖、分化和凋亡。研究表明FRK在多种肿瘤中表达下调,发挥肿瘤抑制作用。FRK的激酶活性可能通过磷酸化底物蛋白来调节细胞功能。
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