FUBP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

FUBP1编码FUSE结合蛋白1,调控MYC等基因表达,参与细胞增殖与凋亡,与多种肿瘤相关。

基因信息卡

基因符号 FUBP1
基因全名 far upstream element binding protein 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p31.1
NCBI Gene ID 8880 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8880
Ensembl ID ENSG00000125740
UniProt ID Q96AE4
OMIM ID 603081
HGNC ID 4004
基因别名 FBP, FUBP, hFUBP1

基因功能与研究简介

FUBP1(far upstream element binding protein 1)编码FUSE结合蛋白1,属于FUBP家族。该蛋白结合至MYC基因上游的FUSE元件,调控MYC的转录活性,从而影响细胞增殖、凋亡和分化。FUBP1在多种组织中表达,参与DNA损伤应答和RNA加工等过程。研究表明,FUBP1在多种肿瘤中异常表达,与肿瘤发生发展密切相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 FUBP1过表达促进MYC表达,增强细胞增殖和肿瘤生长 较强研究证据
结直肠癌 FUBP1表达上调与肿瘤分期和预后不良相关 较强研究证据
胶质母细胞瘤 FUBP1突变或表达异常可能参与肿瘤发生 潜在关联
非小细胞肺癌 FUBP1表达水平与肿瘤进展相关 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
U87MG 暂无可靠数据 胶质母细胞瘤细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致FUBP1蛋白表达减少或功能缺失,可能影响MYC调控,与肿瘤发生相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,增强FUBP1活性,可能促进MYC表达和细胞增殖。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,突变蛋白干扰正常FUBP1功能,影响下游基因表达。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II

相关通路

hsa05200 Pathways in cancer
hsa04068 FoxO signaling pathway
hsa04110 Cell cycle

蛋白质功能简介

FUBP1蛋白包含一个N端DNA结合域和一个C端转录激活域,通过结合FUSE元件调控MYC基因的转录。FUBP1还参与RNA剪接和DNA损伤修复。其表达水平在多种肿瘤中升高,与不良预后相关。

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