FUBP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
FUBP1编码FUSE结合蛋白1,调控MYC等基因表达,参与细胞增殖与凋亡,与多种肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | FUBP1 |
|---|---|
| 基因全名 | far upstream element binding protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p31.1 |
| NCBI Gene ID | 8880 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8880 |
| Ensembl ID | ENSG00000125740 |
| UniProt ID | Q96AE4 |
| OMIM ID | 603081 |
| HGNC ID | 4004 |
| 基因别名 | FBP, FUBP, hFUBP1 |
基因功能与研究简介
FUBP1(far upstream element binding protein 1)编码FUSE结合蛋白1,属于FUBP家族。该蛋白结合至MYC基因上游的FUSE元件,调控MYC的转录活性,从而影响细胞增殖、凋亡和分化。FUBP1在多种组织中表达,参与DNA损伤应答和RNA加工等过程。研究表明,FUBP1在多种肿瘤中异常表达,与肿瘤发生发展密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | FUBP1过表达促进MYC表达,增强细胞增殖和肿瘤生长 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | FUBP1表达上调与肿瘤分期和预后不良相关 | 较强研究证据 |
| 胶质母细胞瘤 | FUBP1突变或表达异常可能参与肿瘤发生 | 潜在关联 |
| 非小细胞肺癌 | FUBP1表达水平与肿瘤进展相关 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| U87MG | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
| c.567delC (p.Leu189fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致FUBP1蛋白表达减少或功能缺失,可能影响MYC调控,与肿瘤发生相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,增强FUBP1活性,可能促进MYC表达和细胞增殖。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变,突变蛋白干扰正常FUBP1功能,影响下游基因表达。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• hsa05200 Pathways in cancer
• hsa04068 FoxO signaling pathway
• hsa04110 Cell cycle
蛋白质功能简介
FUBP1蛋白包含一个N端DNA结合域和一个C端转录激活域,通过结合FUSE元件调控MYC基因的转录。FUBP1还参与RNA剪接和DNA损伤修复。其表达水平在多种肿瘤中升高,与不良预后相关。