GABARAPL1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GABARAPL1是自噬和凋亡调控中的关键蛋白,参与多种癌症的发生发展,是潜在的治疗靶点。

基因信息卡

基因符号 GABARAPL1
基因全名 GABA type A receptor associated protein like 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 12p13.31
NCBI Gene ID 23710 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23710
Ensembl ID ENSG00000139155
UniProt ID Q9H0R8
OMIM ID 607698
HGNC ID 15767
基因别名 APG8L, ATG8L, GEC1

基因功能与研究简介

GABARAPL1(GABA type A receptor associated protein like 1)是自噬相关蛋白ATG8家族的成员之一,参与自噬体形成和选择性自噬过程。该蛋白还参与调控细胞凋亡、细胞增殖和分化。研究表明,GABARAPL1在多种肿瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子发挥作用。此外,GABARAPL1还参与神经退行性疾病和代谢性疾病的发生发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 GABARAPL1在乳腺癌组织中表达下调,可能通过调控自噬和凋亡影响肿瘤进展。 较强研究证据
肝细胞癌 GABARAPL1在肝细胞癌中表达降低,与患者预后不良相关。 较强研究证据
结直肠癌 GABARAPL1表达下调与结直肠癌的侵袭和转移相关。 潜在关联
神经退行性疾病 GABARAPL1参与自噬过程,可能影响神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)的病理过程。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.456delA (p.Lys152fs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致GABARAPL1蛋白功能丧失或减弱,可能促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明GABARAPL1存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:目前暂无明确证据表明GABARAPL1存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006914 (autophagy) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0005768 (endosome)
• GO:0005776 (autophagosome membrane)

相关通路

hsa04140 (Autophagy - animal)
hsa04210 (Apoptosis)

蛋白质功能简介

GABARAPL1蛋白属于ATG8家族,包含一个泛素样结构域,能够与自噬体膜上的磷脂酰乙醇胺结合,参与自噬体的形成和成熟。该蛋白还通过与GABA受体相互作用,参与神经信号传导。在细胞应激条件下,GABARAPL1表达上调,促进自噬以维持细胞稳态。在肿瘤中,GABARAPL1表达下调,导致自噬受损,可能促进肿瘤发生。

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