GABARAPL1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
GABARAPL1是自噬和凋亡调控中的关键蛋白,参与多种癌症的发生发展,是潜在的治疗靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | GABARAPL1 |
|---|---|
| 基因全名 | GABA type A receptor associated protein like 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12p13.31 |
| NCBI Gene ID | 23710 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23710 |
| Ensembl ID | ENSG00000139155 |
| UniProt ID | Q9H0R8 |
| OMIM ID | 607698 |
| HGNC ID | 15767 |
| 基因别名 | APG8L, ATG8L, GEC1 |
基因功能与研究简介
GABARAPL1(GABA type A receptor associated protein like 1)是自噬相关蛋白ATG8家族的成员之一,参与自噬体形成和选择性自噬过程。该蛋白还参与调控细胞凋亡、细胞增殖和分化。研究表明,GABARAPL1在多种肿瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子发挥作用。此外,GABARAPL1还参与神经退行性疾病和代谢性疾病的发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | GABARAPL1在乳腺癌组织中表达下调,可能通过调控自噬和凋亡影响肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | GABARAPL1在肝细胞癌中表达降低,与患者预后不良相关。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | GABARAPL1表达下调与结直肠癌的侵袭和转移相关。 | 潜在关联 |
| 神经退行性疾病 | GABARAPL1参与自噬过程,可能影响神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)的病理过程。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Trp) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.456delA (p.Lys152fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致GABARAPL1蛋白功能丧失或减弱,可能促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:目前暂无明确证据表明GABARAPL1存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:目前暂无明确证据表明GABARAPL1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006914 (autophagy) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005768 (endosome) |
| • GO:0005776 (autophagosome membrane) |
相关通路
• hsa04140 (Autophagy - animal)
• hsa04210 (Apoptosis)
蛋白质功能简介
GABARAPL1蛋白属于ATG8家族,包含一个泛素样结构域,能够与自噬体膜上的磷脂酰乙醇胺结合,参与自噬体的形成和成熟。该蛋白还通过与GABA受体相互作用,参与神经信号传导。在细胞应激条件下,GABARAPL1表达上调,促进自噬以维持细胞稳态。在肿瘤中,GABARAPL1表达下调,导致自噬受损,可能促进肿瘤发生。