GALNT11基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
GALNT11编码多肽N-乙酰半乳糖胺基转移酶11,参与O-糖基化修饰,与肾脏发育和多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | GALNT11 |
|---|---|
| 基因全名 | polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 11 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7q36.1 |
| NCBI Gene ID | 63917 ncbi.nlm.nih.gov/gene/63917 |
| Ensembl ID | ENSG00000106524 |
| UniProt ID | Q8NCB3 |
| OMIM ID | 615857 |
| HGNC ID | 23273 |
| 基因别名 | GALNAC-T11, pp-GalNAc-T11 |
基因功能与研究简介
GALNT11基因编码多肽N-乙酰半乳糖胺基转移酶11(pp-GalNAc-T11),属于GalNAc转移酶家族,负责将N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)转移到蛋白质的丝氨酸或苏氨酸残基上,启动O-连接糖基化。该酶在多种组织中表达,尤其在肾脏中高表达,参与肾脏发育和功能调节。GALNT11的突变与先天性肾脏和泌尿道异常(CAKUT)相关,并可能影响其他生理过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性肾脏和泌尿道异常(CAKUT) | GALNT11突变导致蛋白功能丧失,影响肾脏发育中的信号通路,导致肾脏结构异常。 | ClinVar, OMIM |
| 肾发育不全 | GALNT11突变与肾发育不全相关,可能通过影响肾单位形成。 | ClinVar |
| 膀胱输尿管反流 | GALNT11突变可能增加膀胱输尿管反流风险,但证据有限。 | ClinVar |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1123C>T (p.Arg375Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1555G>A (p.Gly519Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1966C>T (p.Arg656Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000139 - Golgi membrane | • GO:0004653 - polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity |
| • GO:0006493 - protein O-linked glycosylation | • GO:0005794 - Golgi apparatus |
相关通路
• O-linked glycosylation (Reactome: R-HSA-5173105)
蛋白质功能简介
GALNT11蛋白是II型跨膜蛋白,定位于高尔基体,具有N-乙酰半乳糖胺转移酶活性。它催化O-连接糖基化的第一步,将GalNAc转移到蛋白质底物上。该蛋白在肾脏发育中发挥重要作用,可能通过调节Notch信号通路影响肾单位形成。