GAPVD1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

GAPVD1编码GTPase激活蛋白,参与膜运输和信号转导,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 GAPVD1
基因全名 GTPase activating protein and VPS9 domains 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q33.3
NCBI Gene ID 25902 ncbi.nlm.nih.gov/gene/25902
Ensembl ID ENSG00000107175
UniProt ID Q14C86
OMIM ID 610651
HGNC ID 24968
基因别名 GAPVD1, KIAA1621, RAB5GAP, GAPE

基因功能与研究简介

GAPVD1基因编码一种含有GTPase激活蛋白(GAP)结构域和VPS9结构域的蛋白质。该蛋白作为RAB5的GTPase激活蛋白,负调控内体运输,并参与受体介导的内吞作用。GAPVD1还通过其VPS9结构域作为鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)激活RAB5,从而在膜运输和信号转导中发挥双重调节作用。研究表明,GAPVD1在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生和发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 GAPVD1在多种癌症中表达上调,可能通过调控内体运输影响细胞增殖和迁移。 较强研究证据
神经发育障碍 GAPVD1突变与神经发育障碍相关,但具体机制尚不明确。 潜在关联
免疫相关疾病 GAPVD1参与免疫细胞信号转导,可能影响免疫应答。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
A549 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能
c.2345delC (p.Pro782LeufsTer5) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响GAP和VPS9结构域功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,目前暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,目前暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005096 GTPase activator activity • GO:0005085 guanyl-nucleotide exchange factor activity
• GO:0006886 intracellular protein transport • GO:0006897 endocytosis
• GO:0016020 membrane

相关通路

Endocytosis
RAB5 regulation

蛋白质功能简介

GAPVD1蛋白包含一个GAP结构域和一个VPS9结构域,具有双重酶活性:作为RAB5的GTPase激活蛋白(GAP)和鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)。这种双重功能使其在调控内体运输和信号转导中发挥关键作用。GAPVD1通过调节RAB5活性影响内吞途径,进而影响细胞表面受体的内化和信号传导。

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