GAR1基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GAR1是端粒酶复合物的核心组分,对端粒维持和基因组稳定性至关重要。

基因信息卡

基因符号 GAR1
基因全名 GAR1 ribonucleoprotein
基因类型 protein-coding
染色体位置 4q25
NCBI Gene ID 54433 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54433
Ensembl ID ENSG00000109534
UniProt ID Q9NY12
OMIM ID 606470
HGNC ID 14264
基因别名 NOLA1, DKC1-interacting protein, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1

基因功能与研究简介

GAR1基因编码端粒酶复合物的一个核心组分,该复合物负责端粒DNA的延长。GAR1蛋白是H/ACA核糖核蛋白复合物的成员,参与端粒酶RNA的稳定和端粒酶的活性。此外,GAR1还参与核糖体RNA的加工和成熟。GAR1的功能对于维持基因组稳定性和细胞增殖至关重要。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
先天性角化不良 GAR1突变可能导致端粒缩短,影响造血和皮肤等组织再生,与先天性角化不良相关。 ClinVar
肺纤维化 GAR1突变可能通过影响端粒长度,增加肺纤维化风险。 ClinVar
再生障碍性贫血 GAR1突变导致端粒酶功能缺陷,可能引起骨髓衰竭。 ClinVar

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
皮肤 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.631C>T (p.Arg211Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.208A>G (p.Thr70Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.497G>A (p.Arg166His) 错义突变 罕见 可能影响RNA结合
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,丧失功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 (RNA binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005654 (nucleoplasm) • GO:0005730 (nucleolus)
• GO:0000338 (H/ACA snoRNP complex) • GO:0000723 (telomere maintenance)

相关通路

Telomere maintenance (Reactome: R-HSA-157579)
rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)

蛋白质功能简介

GAR1蛋白是H/ACA核糖核蛋白复合物的核心组分,该复合物参与端粒酶RNA的稳定和端粒酶的活性。GAR1蛋白包含一个N端结构域和一个C端结构域,C端结构域负责与DKC1相互作用。GAR1还参与核糖体RNA的假尿苷化修饰,影响核糖体的生物发生。

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