GAREM2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达图谱
GAREM2编码一种参与EGFR信号通路调控的接头蛋白,其突变与肿瘤发生相关。
基因信息卡
| 基因符号 | GAREM2 |
|---|---|
| 基因全名 | GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q36.3 |
| NCBI Gene ID | 440275 ncbi.nlm.nih.gov/gene/440275 |
| Ensembl ID | ENSG00000163386 |
| UniProt ID | Q6ZRR7 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:33733 |
| 基因别名 | C2orf86, FAM124B |
基因功能与研究简介
GAREM2(GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2)编码一种接头蛋白,参与EGFR信号通路的调控。该蛋白含有PH结构域和富含脯氨酸的区域,可能通过结合GRB2调节MAPK1的活性。GAREM2在多种组织中表达,尤其在睾丸和脑中较高。研究表明GAREM2可能参与细胞增殖和分化,其异常表达与某些肿瘤相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | GAREM2在肝细胞癌中表达上调,可能通过激活MAPK信号通路促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | GAREM2在结直肠癌中表达异常,与不良预后相关。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | GAREM2在非小细胞肺癌中表达上调,可能参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
| c.567C>T (p.Pro189Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白结构 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0007165 (signal transduction) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) |
相关通路
• EGFR signaling pathway (Reactome: R-HSA-177929)
• MAPK signaling pathway (KEGG: hsa04010)
蛋白质功能简介
GAREM2蛋白由约600个氨基酸组成,包含PH结构域和富含脯氨酸的区域。PH结构域可能介导膜定位,而富含脯氨酸区域可能参与蛋白-蛋白相互作用。GAREM2通过结合GRB2参与EGFR下游信号传导,调节MAPK1的活性。该蛋白在细胞质中表达,可能参与细胞增殖和分化。