GARIN2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

GARIN2(Golgi Associated RAB2 Interactor 2)是高尔基体相关蛋白,参与囊泡运输和细胞自噬,与神经退行性疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 GARIN2
基因全名 Golgi Associated RAB2 Interactor 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q23.1
NCBI Gene ID 100506658 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100506658
Ensembl ID ENSG00000257103
UniProt ID A6NM28
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:37225
基因别名 C14orf102, FAM71A

基因功能与研究简介

GARIN2(Golgi Associated RAB2 Interactor 2)是高尔基体相关蛋白,属于GARIN家族,参与囊泡运输和细胞自噬过程。该基因位于染色体14q23.1,编码一个含有卷曲螺旋结构域的蛋白质。GARIN2通过与RAB2相互作用,调节高尔基体到内质网的囊泡运输,并在自噬过程中发挥作用。研究表明,GARIN2在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。其功能异常可能与神经退行性疾病和癌症相关,但具体机制仍在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
暂无明确疾病关联 暂无明确致病机制 暂无可靠数据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(基于RNA测序)
睾丸 暂无可靠数据 高表达(基于RNA测序)
其他组织 暂无可靠数据 低至中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 内源性表达
HEK293 暂无可靠数据 内源性表达
SH-SY5Y 暂无可靠数据 内源性表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
暂无明确致病突变 暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无明确功能影响
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致GARIN2蛋白功能丧失,影响囊泡运输和自噬过程,但具体疾病关联尚未明确。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无证据表明GARIN2存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前暂无证据表明GARIN2存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005794 (Golgi apparatus) • GO:0006886 (intracellular protein transport)
• GO:0006914 (autophagy) • GO:0005515 (protein binding)

相关通路

暂无明确通路

蛋白质功能简介

GARIN2蛋白由约500个氨基酸组成,含有卷曲螺旋结构域,定位于高尔基体。它通过与RAB2 GTPase相互作用,参与调控高尔基体至内质网的囊泡运输。此外,GARIN2在自噬过程中可能作为支架蛋白,协调自噬体的形成。其表达水平在脑和睾丸中较高,提示其在神经和生殖系统中具有重要功能。

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