GCDH基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GCDH基因编码戊二酰辅酶A脱氢酶,其缺陷导致戊二酸血症I型,是一种常染色体隐性遗传的有机酸代谢病。

基因信息卡

基因符号 GCDH
基因全名 glutaryl-CoA dehydrogenase
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.13
NCBI Gene ID 2639 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2639
Ensembl ID ENSG00000105607
UniProt ID Q92947
OMIM ID 608801
HGNC ID 4189
基因别名 ACAD5, GCD, MGC161688

基因功能与研究简介

GCDH基因编码戊二酰辅酶A脱氢酶,该酶位于线粒体基质,参与赖氨酸、羟赖氨酸和色氨酸的分解代谢途径,催化戊二酰辅酶A脱氢生成戊烯二酰辅酶A。该酶的缺陷导致戊二酸、3-羟基戊二酸等代谢物积累,引起戊二酸血症I型(GA-1),是一种常染色体隐性遗传病。GCDH基因突变可导致酶活性降低或缺失,影响能量代谢和神经系统的正常发育。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
戊二酸血症I型 GCDH基因突变导致戊二酰辅酶A脱氢酶活性缺陷,引起戊二酸、3-羟基戊二酸等有机酸在体内蓄积,主要影响中枢神经系统,导致纹状体变性、运动障碍和脑白质病变。 已明确致病
戊二酸血症I型相关心肌病 部分GA-1患者可伴有心肌病,但具体机制尚不完全清楚,可能与代谢紊乱有关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 高表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1244C>T (p.Arg415Ter) 无义突变 常见突变 Loss of Function
c.914C>T (p.Arg305Trp) 错义突变 常见突变 Loss of Function
c.1204C>T (p.Arg402Trp) 错义突变 少见突变 Loss of Function
c.457C>T (p.Arg153Cys) 错义突变 少见突变 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数GCDH突变导致酶活性降低或缺失,属于功能丧失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明GCDH存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明GCDH存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003995 (acyl-CoA dehydrogenase activity) • GO:0005739 (mitochondrion)
• GO:0006559 (L-lysine catabolic process) • GO:0006560 (tryptophan catabolic process)

相关通路

Lysine degradation (KEGG: hsa00310)
Tryptophan metabolism (KEGG: hsa00380)

蛋白质功能简介

GCDH蛋白由438个氨基酸组成,分子量约48 kDa,定位于线粒体基质。该蛋白属于酰基辅酶A脱氢酶家族,以同源四聚体形式存在,每个亚基含有一个FAD辅基。GCDH催化戊二酰辅酶A脱氢生成戊烯二酰辅酶A,是赖氨酸、羟赖氨酸和色氨酸分解代谢的关键酶。其活性中心包含一个谷氨酸残基(Glu370),在催化过程中起关键作用。

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