GDF3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GDF3是TGF-β超家族成员,参与胚胎发育和脂肪代谢,其突变与Klippel-Feil综合征及肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 GDF3
基因全名 Growth Differentiation Factor 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 12p13.31
NCBI Gene ID 9573 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9573
Ensembl ID ENSG00000184344
UniProt ID Q9NR23
OMIM ID 606232
HGNC ID 4219
基因别名 MCOP7; KFS4; MGC39922

基因功能与研究简介

GDF3(生长分化因子3)是TGF-β超家族的一员,在胚胎发育中发挥重要作用,参与中胚层形成和左右不对称性建立。在成体中,GDF3在脂肪组织中高表达,参与脂肪代谢和能量平衡的调节。GDF3的突变与Klippel-Feil综合征(KFS4)和某些肿瘤的发生相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Klippel-Feil综合征4型 GDF3突变导致Klippel-Feil综合征4型,该病以颈椎融合为特征,致病机制可能涉及GDF3在骨骼发育中的功能异常。 OMIM
肿瘤 GDF3在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控TGF-β信号通路影响肿瘤发生发展,但具体机制尚在研究中。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脂肪组织 暂无可靠数据 高表达
胎盘 暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
脂肪细胞 暂无可靠数据 高表达
胚胎干细胞 暂无可靠数据 高表达
肿瘤细胞系 暂无可靠数据 部分细胞系表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.286C>T (p.Arg96Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

GDF3功能丧失突变可能导致胚胎发育异常和Klippel-Feil综合征。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明GDF3存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明GDF3存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005125 (cytokine activity) • GO:0008083 (growth factor activity)
• GO:0005615 (extracellular space) • GO:0005576 (extracellular region)
• GO:0007165 (signal transduction) • GO:0007179 (transforming growth factor beta receptor signaling pathway)

相关通路

TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells (hsa04550)

蛋白质功能简介

GDF3蛋白是TGF-β超家族成员,由455个氨基酸组成,包含信号肽、前结构域和成熟肽。成熟肽通过二硫键形成同源二聚体,分泌到细胞外,与TGF-β受体结合,激活Smad信号通路,调控靶基因表达。GDF3在胚胎发育中促进中胚层形成,在成体中参与脂肪代谢调节。

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