GEMIN4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GEMIN4是SMN复合体的核心组分,参与剪接体组装和miRNA加工,其突变与多种癌症及神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 GEMIN4
基因全名 gem nuclear organelle associated protein 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 17p13.3
NCBI Gene ID 50628 ncbi.nlm.nih.gov/gene/50628
Ensembl ID ENSG00000173992
UniProt ID P57678
OMIM ID 606969
HGNC ID 15713
基因别名 GEMIN4, SIP1, SIP-1, gem (nuclear organelle) associated protein 4

基因功能与研究简介

GEMIN4(gem nuclear organelle associated protein 4)是SMN复合体的核心组分,参与剪接体snRNP的组装和miRNA加工。该基因位于染色体17p13.3,编码一个含有WD重复结构域的蛋白质。GEMIN4通过与SMN、GEMIN3等蛋白相互作用,在RNA代谢中发挥关键作用。研究表明,GEMIN4的突变或表达异常与多种癌症(如肝癌、乳腺癌)和神经发育障碍(如小头畸形)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 GEMIN4表达下调与肝癌进展相关,可能通过影响miRNA加工促进肿瘤发生。 较强研究证据
乳腺癌 GEMIN4基因多态性与乳腺癌风险相关,可能通过影响miRNA加工影响肿瘤抑制。 较强研究证据
小头畸形 GEMIN4纯合突变导致小头畸形、智力障碍等神经发育异常,机制可能与SMN复合体功能受损有关。 已明确致病
肺癌 GEMIN4表达异常与肺癌预后相关,可能参与肿瘤侵袭和转移。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达(根据GTEx)
甲状腺 暂无可靠数据 高表达
肾上腺 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1000C>T (p.Arg334Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与神经发育障碍相关
c.1576G>A (p.Glu526Lys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与神经发育障碍相关
rs3744741 SNP 常见 与乳腺癌风险相关
rs1062923 SNP 常见 与肝癌风险相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

GEMIN4功能缺失突变(如纯合截短突变)导致SMN复合体功能受损,影响snRNP组装和miRNA加工,与神经发育障碍相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明GEMIN4存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明GEMIN4突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0032797 SMN complex • GO:0044530 SMN-Sm protein complex
• GO:0006397 mRNA processing • GO:0035195 miRNA processing

相关通路

hsa03040 Spliceosome
hsa05169 Epstein-Barr virus infection
hsa05200 Pathways in cancer

蛋白质功能简介

GEMIN4蛋白是SMN复合体的核心组分,含有WD重复结构域,参与snRNP的生物发生和miRNA加工。该蛋白通过与SMN、GEMIN3等相互作用,在RNA代谢中发挥关键作用。GEMIN4的亚细胞定位主要在细胞核和细胞质,参与mRNA剪接和miRNA成熟过程。

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