GGCX基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GGCX编码γ-谷氨酰羧化酶,是维生素K依赖蛋白活化过程中的关键酶,其突变可导致多种出血性疾病和骨骼发育异常。

基因信息卡

基因符号 GGCX
基因全名 gamma-glutamyl carboxylase
基因类型 protein coding
染色体位置 2p11.2
NCBI Gene ID 2677 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2677
Ensembl ID ENSG00000115486
UniProt ID P38435
OMIM ID 137167
HGNC ID 4247
基因别名 VKCFD1, GC, VKGC

基因功能与研究简介

GGCX基因编码γ-谷氨酰羧化酶,该酶位于内质网,催化维生素K依赖蛋白(如凝血因子II、VII、IX、X,蛋白C、S,骨钙素等)中谷氨酸残基的γ-羧化,使其具有生物活性。GGCX功能缺陷可导致维生素K依赖凝血因子缺乏症1型(VKCFD1)和假性弹性纤维黄瘤(PXE)等疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
维生素K依赖凝血因子缺乏症1型(VKCFD1) GGCX基因突变导致γ-谷氨酰羧化酶活性降低,影响维生素K依赖凝血因子的活化,导致出血倾向。 已明确致病
假性弹性纤维黄瘤(PXE) GGCX基因突变可能影响基质Gla蛋白(MGP)的羧化,导致弹性纤维钙化,与PXE相关。 具有较强研究证据
骨质疏松 GGCX基因多态性可能影响骨钙素的羧化,与骨密度降低相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 高表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1121C>T (p.Pro374Leu) 错义突变 罕见 可能影响酶活性
c.763G>A (p.Gly255Arg) 错义突变 罕见 导致酶活性降低
c.1196delC (p.Pro399LeufsTer25) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数GGCX突变导致酶活性降低或丧失,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003846 (gamma-glutamyl carboxylase activity) • GO:0005783 (endoplasmic reticulum)
• GO:0007596 (blood coagulation) • GO:0001503 (ossification)

相关通路

hsa04610 (Complement and coagulation cascades)
hsa00830 (Retinol metabolism)

蛋白质功能简介

GGCX蛋白(UniProt P38435)由758个氨基酸组成,分子量约87.5 kDa。该蛋白为内质网跨膜蛋白,其N端位于胞质,C端位于内质网腔。GGCX催化维生素K依赖蛋白的γ-羧化,需要维生素K氢醌作为辅因子。该酶对凝血因子和骨代谢相关蛋白的活化至关重要。

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