GLI2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
GLI2是Hedgehog信号通路的关键转录因子,其突变可导致多种发育异常和癌症。
基因信息卡
| 基因符号 | GLI2 |
|---|---|
| 基因全名 | GLI family zinc finger 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q14.2 |
| NCBI Gene ID | 2736 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2736 |
| Ensembl ID | ENSG00000074047 |
| UniProt ID | P10070 |
| OMIM ID | 165230 |
| HGNC ID | 4319 |
| 基因别名 | THP1, HPE9, CJS, GLI2α, GLI2β |
基因功能与研究简介
GLI2基因编码一种锌指转录因子,是Hedgehog信号通路的关键效应分子。GLI2在胚胎发育中调控多种基因的表达,参与神经系统、骨骼和内脏器官的形成。GLI2突变可导致Culler-Jones综合征、垂体异常和多种癌症。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Culler-Jones综合征 | GLI2功能缺失突变导致Hedgehog信号减弱,影响胚胎发育,导致多发性先天畸形。 | 已明确致病 |
| 垂体异常 | GLI2突变影响垂体前叶发育,导致生长激素缺乏等内分泌异常。 | 已明确致病 |
| 基底细胞癌 | GLI2异常激活促进肿瘤细胞增殖,与Hedgehog通路异常相关。 | 癌症相关 |
| 髓母细胞瘤 | GLI2扩增或过表达激活Hedgehog信号,促进肿瘤发生。 | 癌症相关 |
| 多指畸形 | GLI2突变影响肢体发育,导致多指(趾)畸形。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.3457C>T (p.Arg1153Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2341C>T (p.Arg781Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| GLI2扩增 | 拷贝数变异 | 在髓母细胞瘤中常见 | Gain of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致GLI2蛋白功能丧失或减弱,常见于Culler-Jones综合征和垂体异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):突变导致GLI2蛋白过度激活,常见于基底细胞癌和髓母细胞瘤。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):突变蛋白干扰正常GLI2功能,但GLI2相关证据较少,暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0007224 (smoothened signaling pathway) |
| • GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II) |
相关通路
• Hedgehog signaling pathway (hsa04340)
• Pathways in cancer (hsa05200)
• Basal cell carcinoma (hsa05217)
蛋白质功能简介
GLI2蛋白属于GLI家族锌指转录因子,包含5个锌指结构域和一个C端激活域。GLI2作为Hedgehog信号通路的主要转录激活因子,在胚胎发育中调控靶基因表达。GLI2蛋白在细胞核中发挥作用,其活性受磷酸化、泛素化等翻译后修饰调控。