GLYCTK基因|基因功能、疾病关联、突变与代谢研究

GLYCTK编码甘油酸激酶,参与丝氨酸代谢,其突变与D-甘油酸尿症相关。

基因信息卡

基因符号 GLYCTK
基因全名 glycerate kinase
基因类型 protein coding
染色体位置 3p21.1
NCBI Gene ID 132158 ncbi.nlm.nih.gov/gene/132158
Ensembl ID ENSG00000163946
UniProt ID Q8IVS8
OMIM ID 610516
HGNC ID 24249
基因别名 HBEBP4

基因功能与研究简介

GLYCTK基因编码甘油酸激酶,该酶催化D-甘油酸转化为2-磷酸甘油酸,参与丝氨酸代谢和糖异生途径。GLYCTK在多种组织中表达,尤其在肝脏和肾脏中高表达。该基因的突变可导致D-甘油酸尿症,这是一种罕见的常染色体隐性遗传病,表现为尿中D-甘油酸排泄增加,部分患者伴有智力障碍和神经系统症状。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
D-甘油酸尿症 GLYCTK基因突变导致甘油酸激酶活性降低或缺失,使D-甘油酸无法正常代谢,在体内蓄积并从尿中排出。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 高表达
肾脏 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.679C>T (p.Arg227Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白质截短,功能丧失
c.823G>A (p.Gly275Arg) 错义突变 罕见 可能影响酶活性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

GLYCTK基因的致病突变通常导致甘油酸激酶活性降低或缺失,属于功能丧失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明GLYCTK存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明GLYCTK存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005524 ATP binding • GO:0008887 glycerate kinase activity
• GO:0005975 carbohydrate metabolic process • GO:0006564 L-serine biosynthetic process

相关通路

Glyoxylate and dicarboxylate metabolism (KEGG: hsa00630)
Glycine
serine and threonine metabolism (KEGG: hsa00260)

蛋白质功能简介

GLYCTK编码的甘油酸激酶属于PLP依赖酶家族,催化D-甘油酸磷酸化生成2-磷酸甘油酸。该酶在丝氨酸代谢和糖异生中发挥重要作用。蛋白质结构包含ATP结合域和底物结合域,其活性受底物浓度调节。

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