GNE基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GNE基因编码UDP-GlcNAc 2-差向异构酶/ManNAc激酶,是唾液酸生物合成的关键酶,其突变可导致遗传性包涵体肌病和唾液酸尿症。

基因信息卡

基因符号 GNE
基因全名 glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase
基因类型 protein-coding
染色体位置 9p13.3
NCBI Gene ID 10020 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10020
Ensembl ID ENSG00000159921
UniProt ID Q9Y223
OMIM ID 603824
HGNC ID 4370
基因别名 UDP-GlcNAc 2-epimerase/ManNAc kinase; GLCNE; IBM2; NMNAT; SLC35A3

基因功能与研究简介

GNE基因编码UDP-GlcNAc 2-差向异构酶/N-乙酰甘露糖胺激酶,是唾液酸生物合成途径中的关键酶。该酶催化UDP-GlcNAc转化为ManNAc,并进一步磷酸化生成ManNAc-6-磷酸,最终合成唾液酸。唾液酸是细胞表面糖蛋白和糖脂的重要组分,参与细胞黏附、信号传导和免疫调节。GNE基因突变可导致两种常染色体隐性遗传病:遗传性包涵体肌病(HIBM)和唾液酸尿症。HIBM以进行性肌无力和肌萎缩为主要特征,而唾液酸尿症表现为唾液酸在尿液中过量排泄。此外,GNE基因在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
遗传性包涵体肌病(HIBM) GNE基因突变导致酶活性降低,唾液酸合成减少,影响肌肉细胞膜糖基化,导致肌纤维变性。 已明确致病
唾液酸尿症 GNE基因突变导致酶功能缺失,唾液酸合成障碍,过量唾液酸从尿液排出。 已明确致病
癌症(潜在关联) GNE表达异常可能影响肿瘤细胞表面唾液酸化,促进肿瘤侵袭和转移。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肌肉 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
p.Met712Thr 错义突变 常见于HIBM患者 酶活性降低,导致唾液酸合成减少
p.Val603Met 错义突变 常见于HIBM患者 酶活性降低,导致唾液酸合成减少
p.Arg266Trp 错义突变 罕见 酶活性降低,导致唾液酸合成减少
p.Leu166Pro 错义突变 罕见 酶活性降低,导致唾液酸合成减少
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数GNE突变导致酶活性降低或丧失,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明GNE存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明GNE突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006047 - UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase activity • GO:0009384 - N-acylmannosamine kinase activity
• GO:0006051 - N-acetylneuraminate biosynthetic process • GO:0005829 - cytosol
• GO:0005737 - cytoplasm

相关通路

hsa00520 - Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
hsa00530 - Glycosaminoglycan biosynthesis - keratan sulfate
hsa00531 - Glycosaminoglycan degradation

蛋白质功能简介

GNE蛋白由722个氨基酸组成,包含两个功能域:N端的UDP-GlcNAc 2-差向异构酶域和C端的ManNAc激酶域。该蛋白以双功能酶形式参与唾液酸合成,其活性受CMP-唾液酸反馈抑制。GNE蛋白在肌肉、肝脏和肾脏中高表达,在细胞质中发挥功能。突变导致酶活性降低,影响唾液酸合成,进而导致疾病。

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