GOPC基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GOPC基因编码高尔基体相关PDZ结构域蛋白,参与蛋白质运输和细胞极性调控,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 GOPC
基因全名 golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing
基因类型 protein coding
染色体位置 6q22.1
NCBI Gene ID 57120 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57120
Ensembl ID ENSG00000112294
UniProt ID Q9HD26
OMIM ID 606845
HGNC ID 17643
基因别名 CAL, dJ94G16.2, GOPC1, PIST, FIG

基因功能与研究简介

GOPC基因编码高尔基体相关PDZ和卷曲螺旋结构域蛋白,该蛋白在细胞内参与蛋白质运输、膜泡运输和细胞极性调控。GOPC蛋白通过与多种蛋白相互作用,如CASP8AP2、CFTR等,调节其定位和功能。GOPC基因突变与多种疾病相关,包括男性不育、脑室周围结节性异位和某些癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
男性不育 GOPC基因突变导致精子发生障碍,影响精子形态和功能,已明确致病。 OMIM
脑室周围结节性异位 GOPC基因突变与脑室周围结节性异位相关,可能通过影响神经元迁移。 OMIM
癌症 GOPC基因在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生发展,但具体机制尚不明确。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.567_568del (p.Glu190fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
c.890C>T (p.Pro297Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

GOPC基因的移码突变或截短突变可能导致蛋白功能丧失,影响蛋白质运输和细胞极性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明GOPC基因存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明GOPC基因突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005794 Golgi apparatus
• GO:0006886 intracellular protein transport • GO:0030054 cell junction
• GO:0005813 centrosome

相关通路

hsa04144 Endocytosis
hsa04530 Tight junction

蛋白质功能简介

GOPC蛋白包含PDZ结构域和卷曲螺旋结构域,定位于高尔基体和细胞质。它参与蛋白质运输和膜泡运输,通过与CFTR、CASP8AP2等蛋白相互作用调节其功能。GOPC在精子发生和神经元迁移中发挥重要作用,其突变可导致男性不育和脑室周围结节性异位。

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