GPKOW基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GPKOW基因编码一种含有G-patch和KOW结构域的RNA结合蛋白,参与RNA剪接和基因表达调控,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 GPKOW
基因全名 G-patch domain and KOW motifs
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xp11.23
NCBI Gene ID 27238 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27238
Ensembl ID ENSG00000168268
UniProt ID Q92917
OMIM ID 300858
HGNC ID 18130
基因别名 GPATC8, MGC26577

基因功能与研究简介

GPKOW基因编码一种含有G-patch和KOW结构域的RNA结合蛋白,定位于细胞核,参与RNA剪接和基因表达调控。该蛋白可能通过结合RNA和蛋白质,在剪接体组装和mRNA加工中发挥作用。GPKOW基因突变与多种疾病相关,包括发育异常和癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
发育异常 GPKOW基因突变可能导致剪接异常,影响胚胎发育,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
癌症 GPKOW在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控RNA剪接影响肿瘤发生发展。 具有较强研究证据
智力障碍 有报道称GPKOW突变与X连锁智力障碍相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能
c.456C>T (p.R152*) 无义突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白功能丧失,可能引起剪接异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0000398 mRNA splicing • via spliceosome

相关通路

Spliceosome (hsa03040)

蛋白质功能简介

GPKOW蛋白含有G-patch结构域和KOW基序,属于RNA结合蛋白家族。该蛋白定位于细胞核,参与前体mRNA的剪接过程,可能通过与其他剪接因子相互作用调控基因表达。GPKOW在多种组织中表达,其异常表达与肿瘤发生相关。

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