GPKOW基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
GPKOW基因编码一种含有G-patch和KOW结构域的RNA结合蛋白,参与RNA剪接和基因表达调控,与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | GPKOW |
|---|---|
| 基因全名 | G-patch domain and KOW motifs |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | Xp11.23 |
| NCBI Gene ID | 27238 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27238 |
| Ensembl ID | ENSG00000168268 |
| UniProt ID | Q92917 |
| OMIM ID | 300858 |
| HGNC ID | 18130 |
| 基因别名 | GPATC8, MGC26577 |
基因功能与研究简介
GPKOW基因编码一种含有G-patch和KOW结构域的RNA结合蛋白,定位于细胞核,参与RNA剪接和基因表达调控。该蛋白可能通过结合RNA和蛋白质,在剪接体组装和mRNA加工中发挥作用。GPKOW基因突变与多种疾病相关,包括发育异常和癌症。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 发育异常 | GPKOW基因突变可能导致剪接异常,影响胚胎发育,但具体机制尚不明确。 | 暂无明确证据 |
| 癌症 | GPKOW在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控RNA剪接影响肿瘤发生发展。 | 具有较强研究证据 |
| 智力障碍 | 有报道称GPKOW突变与X连锁智力障碍相关,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
| c.456C>T (p.R152*) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白功能丧失,可能引起剪接异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0000398 mRNA splicing | • via spliceosome |
相关通路
• Spliceosome (hsa03040)
蛋白质功能简介
GPKOW蛋白含有G-patch结构域和KOW基序,属于RNA结合蛋白家族。该蛋白定位于细胞核,参与前体mRNA的剪接过程,可能通过与其他剪接因子相互作用调控基因表达。GPKOW在多种组织中表达,其异常表达与肿瘤发生相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|