GREB1L基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
GREB1L是肾脏发育和雌激素信号调控中的关键基因,其突变与先天性肾脏和泌尿道异常密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | GREB1L |
|---|---|
| 基因全名 | Growth Regulation by Estrogen in Breast Cancer 1 Like |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 18q11.2 |
| NCBI Gene ID | 80000 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80000 |
| Ensembl ID | ENSG00000141456 |
| UniProt ID | Q9C091 |
| OMIM ID | 617782 |
| HGNC ID | 31042 |
| 基因别名 | GREB1, FLJ13910, MGC126851, MGC126853 |
基因功能与研究简介
GREB1L(Growth Regulation by Estrogen in Breast Cancer 1 Like)基因编码一种与GREB1相关的蛋白,参与雌激素信号调控和肾脏发育。研究表明,GREB1L在胚胎发育中表达于肾脏前体细胞,对肾单位形成至关重要。其突变可导致先天性肾脏和泌尿道异常(CAKUT),包括肾发育不全、肾缺如等。此外,GREB1L可能参与某些癌症的发生发展,但具体机制尚需进一步研究。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性肾脏和泌尿道异常(CAKUT) | GREB1L突变导致肾脏发育异常,可能通过影响视黄酸信号通路或细胞增殖凋亡平衡,导致肾单位形成障碍。 | 已明确致病 |
| 肾发育不全 | GREB1L功能缺失导致肾脏发育不全,属于CAKUT的一种表现。 | 已明确致病 |
| 肾缺如 | 严重突变可导致单侧或双侧肾缺如。 | 已明确致病 |
| 膀胱输尿管反流 | 部分CAKUT患者伴有膀胱输尿管反流,可能与GREB1L突变相关。 | 具有较强研究证据 |
| 前列腺癌 | GREB1L在雄激素受体信号中可能发挥作用,但具体关联尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达于胎儿肾脏 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 受雌激素调控 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 可能表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 可能表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系,可能内源性表达 |
| MCF-7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系,雌激素反应性 |
| RPTEC | 暂无可靠数据 | 肾近端小管上皮细胞,可能表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1543C>T (p.Arg515Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.2020_2021del (p.Leu674ValfsTer3) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.245G>A (p.Trp82Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.1186A>G (p.Thr396Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但需进一步验证 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,如无义突变、移码突变,导致蛋白截短或降解,使GREB1L功能丧失,是CAKUT的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明GREB1L存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明GREB1L突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II) |
| • GO:0001657 (ureteric bud development) | • GO:0001822 (kidney development) |
相关通路
• Retinoic acid signaling pathway
• Estrogen signaling pathway
蛋白质功能简介
GREB1L蛋白由约1300个氨基酸组成,含有多个功能域,包括N端的富含脯氨酸区域和C端的核定位信号。该蛋白主要定位于细胞质和细胞核,可能作为转录共调节因子参与基因表达调控。在肾脏发育中,GREB1L与视黄酸信号通路相互作用,调节肾单位祖细胞的增殖和分化。此外,GREB1L在雌激素受体阳性乳腺癌细胞中表达上调,提示其可能参与雌激素介导的细胞增殖。