GREM2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
GREM2编码骨形态发生蛋白拮抗剂,调控骨骼发育与器官纤维化,与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | GREM2 |
|---|---|
| 基因全名 | gremlin 2, DAN family BMP antagonist |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q43 |
| NCBI Gene ID | 64388 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64388 |
| Ensembl ID | ENSG00000166923 |
| UniProt ID | Q9H772 |
| OMIM ID | 603699 |
| HGNC ID | 17655 |
| 基因别名 | CKTSF1B2, DAND3, PRDC |
基因功能与研究简介
GREM2(gremlin 2, DAN family BMP antagonist)基因编码骨形态发生蛋白(BMP)的拮抗剂,属于DAN家族。该蛋白通过结合BMP配体,抑制BMP信号通路,从而在胚胎发育、骨骼形成、器官纤维化等过程中发挥重要调控作用。GREM2在多种组织中表达,其表达异常与多种疾病相关,包括骨骼发育异常、肺纤维化、肾纤维化以及某些癌症。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 骨量减少 | GREM2通过抑制BMP信号通路影响成骨细胞分化和骨形成,其功能缺失可能导致骨量减少。 | OMIM |
| 肺纤维化 | GREM2在肺纤维化中表达上调,通过抑制BMP信号促进成纤维细胞增殖和细胞外基质沉积。 | PubMed |
| 肾纤维化 | GREM2在肾纤维化中表达增加,参与肾小管间质纤维化的进程。 | PubMed |
| 癌症 | GREM2在多种癌症中表达异常,可能通过调控BMP信号影响肿瘤细胞增殖、侵袭和转移。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺腺癌细胞系 |
| HK-2 | 暂无可靠数据 | 肾近端小管上皮细胞系 |
| MG-63 | 暂无可靠数据 | 骨肉瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.346C>T (p.Arg116Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.463G>A (p.Val155Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失型突变):导致GREM2蛋白功能丧失或减弱,可能影响BMP信号通路的抑制,导致骨形成异常或纤维化。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明GREM2存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明GREM2存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005125 (cytokine activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005615 (extracellular space) | • GO:0030514 (negative regulation of BMP signaling pathway) |
| • GO:0001657 (ureteric bud development) |
相关通路
• hsa04350 (TGF-beta signaling pathway)
• hsa04340 (Hedgehog signaling pathway)
蛋白质功能简介
GREM2蛋白属于DAN家族,是BMP信号的拮抗剂。它通过直接结合BMP配体(如BMP2、BMP4)阻止其与受体结合,从而抑制BMP信号通路。GREM2在胚胎发育中参与肢体形成、肾脏发育等过程,在成体中调节组织稳态。其表达异常与纤维化和肿瘤发生相关。