GRN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
GRN基因编码颗粒蛋白前体,其单倍剂量不足导致额颞叶痴呆,完全缺失导致神经元蜡样脂褐质沉积症,是神经退行性疾病研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | GRN |
|---|---|
| 基因全名 | granulin precursor |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 17q21.31 |
| NCBI Gene ID | 2896 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2896 |
| Ensembl ID | ENSG00000030582 |
| UniProt ID | P28799 |
| OMIM ID | 138945 |
| HGNC ID | 4601 |
| 基因别名 | CLN11, GEP, GP88, PCDGF, PEPI, PGRN |
基因功能与研究简介
GRN基因编码颗粒蛋白前体(progranulin, PGRN),是一种广泛表达的生长因子样蛋白,在多种组织中发挥重要作用。PGRN经蛋白酶水解后产生多个颗粒蛋白(granulin)肽段。PGRN参与溶酶体功能、炎症调控、神经保护、肿瘤发生等多种生物学过程。GRN基因突变可导致两种主要神经退行性疾病:额颞叶痴呆(FTD)和神经元蜡样脂褐质沉积症(NCL)。此外,GRN表达异常与多种癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 额颞叶痴呆 | GRN单倍剂量不足导致PGRN水平降低,影响溶酶体功能,导致TDP-43蛋白聚集,引起神经退行性变。 | 已明确致病 |
| 神经元蜡样脂褐质沉积症11型 | GRN纯合或复合杂合突变导致PGRN完全缺失,引起溶酶体贮积病,表现为进行性视力丧失、癫痫和运动障碍。 | 已明确致病 |
| 癌症 | GRN在多种肿瘤中高表达,促进肿瘤细胞增殖、侵袭和血管生成,与不良预后相关。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.26C>A (p.Ala9Asp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与FTD相关 |
| c.675_676delCA (p.Thr225fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关 |
| c.1477C>T (p.Arg493*) | 无义突变 | 罕见 | 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关 |
| c.911G>A (p.Trp304*) | 无义突变 | 罕见 | 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关 |
| c.1145G>A (p.Trp382*) | 无义突变 | 罕见 | 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关 |
| c.1477C>T (p.Arg493*) | 无义突变 | 罕见 | 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关 |
| c.911G>A (p.Trp304*) | 无义突变 | 罕见 | 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关 |
| c.1145G>A (p.Trp382*) | 无义突变 | 罕见 | 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
GRN突变导致单倍剂量不足或功能丧失,是FTD和NCL的主要机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0008083 growth factor activity | • GO:0005576 extracellular region |
| • GO:0005764 lysosome | • GO:0005615 extracellular space |
| • GO:0008283 cell population proliferation | • GO:0006954 inflammatory response |
| • GO:0007399 nervous system development | • GO:0006915 apoptotic process |
相关通路
• hsa04142 Lysosome
• hsa05010 Alzheimer disease
• hsa05022 Pathways of neurodegeneration - multiple diseases
蛋白质功能简介
颗粒蛋白前体(PGRN)是一种分泌性糖蛋白,由GRN基因编码。PGRN在多种组织和细胞中表达,尤其在免疫细胞和神经元中高表达。PGRN可被蛋白酶水解为多个颗粒蛋白(granulin)肽段,这些肽段具有不同的生物学功能。PGRN参与溶酶体生物发生和功能调控,通过调节组织蛋白酶D(CTSD)等酶的活性影响溶酶体降解过程。PGRN还参与炎症反应、细胞增殖、神经保护等过程。GRN突变导致PGRN水平降低或功能缺失,是FTD和NCL的致病原因。
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