GRN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GRN基因编码颗粒蛋白前体,其单倍剂量不足导致额颞叶痴呆,完全缺失导致神经元蜡样脂褐质沉积症,是神经退行性疾病研究的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 GRN
基因全名 granulin precursor
基因类型 protein coding
染色体位置 17q21.31
NCBI Gene ID 2896 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2896
Ensembl ID ENSG00000030582
UniProt ID P28799
OMIM ID 138945
HGNC ID 4601
基因别名 CLN11, GEP, GP88, PCDGF, PEPI, PGRN

基因功能与研究简介

GRN基因编码颗粒蛋白前体(progranulin, PGRN),是一种广泛表达的生长因子样蛋白,在多种组织中发挥重要作用。PGRN经蛋白酶水解后产生多个颗粒蛋白(granulin)肽段。PGRN参与溶酶体功能、炎症调控、神经保护、肿瘤发生等多种生物学过程。GRN基因突变可导致两种主要神经退行性疾病:额颞叶痴呆(FTD)和神经元蜡样脂褐质沉积症(NCL)。此外,GRN表达异常与多种癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
额颞叶痴呆 GRN单倍剂量不足导致PGRN水平降低,影响溶酶体功能,导致TDP-43蛋白聚集,引起神经退行性变。 已明确致病
神经元蜡样脂褐质沉积症11型 GRN纯合或复合杂合突变导致PGRN完全缺失,引起溶酶体贮积病,表现为进行性视力丧失、癫痫和运动障碍。 已明确致病
癌症 GRN在多种肿瘤中高表达,促进肿瘤细胞增殖、侵袭和血管生成,与不良预后相关。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.26C>A (p.Ala9Asp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与FTD相关
c.675_676delCA (p.Thr225fs) 移码突变 罕见 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关
c.1477C>T (p.Arg493*) 无义突变 罕见 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关
c.911G>A (p.Trp304*) 无义突变 罕见 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关
c.1145G>A (p.Trp382*) 无义突变 罕见 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关
c.1477C>T (p.Arg493*) 无义突变 罕见 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关
c.911G>A (p.Trp304*) 无义突变 罕见 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关
c.1145G>A (p.Trp382*) 无义突变 罕见 导致提前终止,单倍剂量不足,与FTD相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

GRN突变导致单倍剂量不足或功能丧失,是FTD和NCL的主要机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0008083 growth factor activity • GO:0005576 extracellular region
• GO:0005764 lysosome • GO:0005615 extracellular space
• GO:0008283 cell population proliferation • GO:0006954 inflammatory response
• GO:0007399 nervous system development • GO:0006915 apoptotic process

相关通路

hsa04142 Lysosome
hsa05010 Alzheimer disease
hsa05022 Pathways of neurodegeneration - multiple diseases

蛋白质功能简介

颗粒蛋白前体(PGRN)是一种分泌性糖蛋白,由GRN基因编码。PGRN在多种组织和细胞中表达,尤其在免疫细胞和神经元中高表达。PGRN可被蛋白酶水解为多个颗粒蛋白(granulin)肽段,这些肽段具有不同的生物学功能。PGRN参与溶酶体生物发生和功能调控,通过调节组织蛋白酶D(CTSD)等酶的活性影响溶酶体降解过程。PGRN还参与炎症反应、细胞增殖、神经保护等过程。GRN突变导致PGRN水平降低或功能缺失,是FTD和NCL的致病原因。

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