GSDMA基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GSDMA(Gasdermin A)是细胞焦亡的关键效应分子,参与皮肤炎症和自身免疫疾病,其突变与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 GSDMA
基因全名 Gasdermin A
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q21.1
NCBI Gene ID 284912 ncbi.nlm.nih.gov/gene/284912
Ensembl ID ENSG00000167914
UniProt ID Q96QA5
OMIM ID 607108
HGNC ID 17710
基因别名 GSDM1, FKSG9

基因功能与研究简介

GSDMA(Gasdermin A)是gasdermin蛋白家族成员,主要在皮肤、食管和胃等上皮组织中表达。GSDMA蛋白包含N端成孔结构域和C端抑制结构域,在炎症性半胱天冬酶切割后,N端结构域释放并在细胞膜上形成孔洞,导致细胞焦亡。GSDMA在皮肤炎症、自身免疫疾病和肿瘤中发挥重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
哮喘 GSDMA基因多态性与哮喘易感性相关,可能通过影响气道上皮屏障功能参与疾病发生。 GWAS研究,PMID: 17611496
过敏性鼻炎 GSDMA变异与过敏性鼻炎风险相关,可能涉及上皮屏障功能。 GWAS研究,PMID: 20860503
银屑病 GSDMA表达上调可能促进角质形成细胞焦亡,参与银屑病炎症反应。 表达研究,PMID: 28481373
胃癌 GSDMA在胃癌中表达下调,可能作为抑癌基因,其启动子甲基化导致失活。 表达研究,PMID: 19278955

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 高表达
食管 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HaCaT 暂无可靠数据 角质形成细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs3894194 SNP 0.3 与哮喘风险相关,位于启动子区域,可能影响转录活性。
rs7212938 SNP 0.2 与过敏性鼻炎相关,可能影响基因表达。
c.487C>T (p.Arg163Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响未知。
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

GSDMA功能缺失突变可能削弱细胞焦亡能力,导致病原体清除障碍或肿瘤抑制功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

GSDMA功能获得性突变可能增强细胞焦亡,导致过度炎症和组织损伤。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明GSDMA存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0016020 membrane
• GO:0031640 killing of cells of other organism • GO:0045087 innate immune response
• GO:0006915 apoptotic process • GO:0070269 pyroptosis

相关通路

Pyroptosis pathway (KEGG: hsa04217)
Inflammasome pathway (Reactome: R-HSA-622312)

蛋白质功能简介

GSDMA蛋白属于gasdermin家族,包含N端成孔结构域和C端抑制结构域。在静息状态下,C端结构域抑制N端活性。当炎症性caspase(如caspase-1)切割连接区后,N端结构域释放并寡聚化,在细胞膜上形成孔洞,导致细胞肿胀、裂解和促炎因子释放,即细胞焦亡。GSDMA主要在皮肤、食管和胃等上皮组织中表达,参与皮肤屏障防御和炎症反应。

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