GSDMB基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

GSDMB(Gasdermin B)是gasdermin家族成员,参与细胞焦亡、免疫调节及肿瘤发生,其表达和突变与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 GSDMB
基因全名 Gasdermin B
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q21.1
NCBI Gene ID 55876 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55876
Ensembl ID ENSG00000073605
UniProt ID Q8TAX0
OMIM ID 611221
HGNC ID 30079
基因别名 GSDML, PP4052, PRO2521

基因功能与研究简介

GSDMB(Gasdermin B)是gasdermin家族成员,编码的蛋白质包含N端成孔结构域和C端抑制结构域。GSDMB在多种组织中表达,尤其在免疫细胞和上皮细胞中。它参与细胞焦亡(pyroptosis)、炎症反应和免疫调节。GSDMB的异常表达和突变与多种疾病相关,包括哮喘、炎症性肠病和某些癌症。研究表明,GSDMB可能通过调控细胞死亡和炎症信号通路影响疾病进程。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
哮喘 GSDMB表达增加与哮喘风险相关,可能通过影响气道上皮细胞焦亡和炎症反应参与发病。 GWAS关联,功能研究
炎症性肠病 GSDMB变异与炎症性肠病风险相关,可能通过调节肠道上皮屏障和免疫反应。 GWAS关联
癌症 GSDMB在多种癌症中表达异常,可能通过调控细胞焦亡和肿瘤微环境影响肿瘤进展。 表达分析,功能研究

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
肠道 暂无可靠数据 暂无可靠数据
免疫细胞 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
A549 暂无可靠数据 暂无可靠数据
THP-1 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs11078928 SNV 人群频率约30% 可能影响GSDMB剪接,与哮喘风险相关
rs2305480 SNV 人群频率约40% 可能影响GSDMB表达,与炎症性肠病相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006915 (apoptotic process) • GO:0012501 (programmed cell death)
• GO:0006954 (inflammatory response) • GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

KEGG: Pyroptosis (hsa04217)
Reactome: Programmed Cell Death

蛋白质功能简介

GSDMB蛋白属于gasdermin家族,包含N端成孔结构域和C端抑制结构域。在特定条件下,C端结构域被切割后,N端结构域可插入细胞膜形成孔道,导致细胞焦亡。GSDMB在免疫细胞和上皮细胞中表达,参与炎症反应和宿主防御。其异常表达与多种疾病相关,但具体机制仍在研究中。

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