GTF2E1基因|基因功能、疾病关联、突变与转录机制研究

GTF2E1是通用转录因子IIE亚基α,参与RNA聚合酶II介导的转录起始,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 GTF2E1
基因全名 general transcription factor IIE subunit 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q21.3
NCBI Gene ID 2960 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2960
Ensembl ID ENSG00000114013
UniProt ID P29083
OMIM ID 189962
HGNC ID 4650
基因别名 TF2E1, TFE3, TFIIE-A

基因功能与研究简介

GTF2E1基因编码通用转录因子IIE的α亚基(TFIIE-α),该蛋白与β亚基(GTF2E2)形成异源四聚体,参与RNA聚合酶II介导的转录起始。TFIIE在转录起始前复合物组装中发挥作用,与TFIIH相互作用,调节启动子解链和转录起始。GTF2E1在多种组织中广泛表达,其功能异常与神经发育障碍和癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 GTF2E1突变可能导致转录调控异常,影响神经发育,但具体机制尚在研究中。 ClinVar收录有致病性变异,但证据等级不一。
癌症 GTF2E1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响转录调控参与肿瘤发生,但直接致病证据有限。 COSMIC数据库收录部分体细胞突变,但频率较低。

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失。
c.100C>T (p.Arg34Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常。
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失):突变导致蛋白功能缺失或降低,可能影响转录起始。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明GTF2E1突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):突变蛋白可能干扰正常蛋白功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0006367 transcription initiation at RNA polymerase II promoter • GO:0005634 nucleus

相关通路

RNA polymerase II transcription initiation (Reactome: R-HSA-75955)

蛋白质功能简介

GTF2E1编码的蛋白是通用转录因子IIE的α亚基,分子量约49 kDa。该蛋白包含一个锌指结构域和一个螺旋-环-螺旋结构域,参与与DNA和TFIIH的相互作用。TFIIE在转录起始中促进启动子解链,并调节TFIIH的激酶活性。

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