GTF2E2基因|基因功能、疾病关联、突变与转录机制研究

GTF2E2是通用转录因子IIE的小亚基,参与RNA聚合酶II介导的转录起始,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 GTF2E2
基因全名 General Transcription Factor IIE Subunit 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 8p12
NCBI Gene ID 2961 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2961
Ensembl ID ENSG00000104763
UniProt ID P29084
OMIM ID 189962
HGNC ID 4651
基因别名 TF2E2, TFE, TFIIE-B

基因功能与研究简介

GTF2E2基因编码通用转录因子IIE(TFIIE)的小亚基(β亚基)。TFIIE是RNA聚合酶II介导的转录起始所必需的转录因子之一,与TFIIH相互作用,参与启动子解链和转录起始。GTF2E2在细胞核中表达,对基因表达调控至关重要。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 GTF2E2基因突变可导致常染色体隐性遗传的神经发育障碍,表现为智力障碍、发育迟缓等。 OMIM
癌症相关 部分肿瘤中观察到GTF2E2表达异常,但具体机制尚不明确。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.424C>T (p.Arg142Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白质截短,可能引起疾病
c.586G>A (p.Gly196Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质功能,与神经发育障碍相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):无义突变或移码突变导致蛋白质功能丧失,是神经发育障碍的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明GTF2E2存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明GTF2E2突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005669 (transcription factor TFIID complex) • GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

hsa03022 (Basal transcription factors)
R-HSA-73776 (RNA Polymerase II Transcription Initiation)

蛋白质功能简介

GTF2E2蛋白是TFIIE复合物的β亚基,与α亚基(GTF2E1)形成异源四聚体。TFIIE在转录起始中招募TFIIH并调节其激酶活性,促进启动子解链。GTF2E2蛋白包含一个锌指结构域和一个螺旋-环-螺旋结构域,参与蛋白质-蛋白质相互作用。

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