GTF2F2基因|基因功能、疾病关联、突变与转录机制研究

GTF2F2是通用转录因子IIF的第二大亚基,参与RNA聚合酶II介导的转录起始和延伸,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 GTF2F2
基因全名 General Transcription Factor IIF Subunit 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 13q14.12
NCBI Gene ID 2960 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2960
Ensembl ID ENSG00000100142
UniProt ID P13984
OMIM ID 189969
HGNC ID 4652
基因别名 RAP30; TFIIF-beta; TFIIF

基因功能与研究简介

GTF2F2基因编码通用转录因子IIF(TFIIF)的β亚基。TFIIF是RNA聚合酶II转录起始复合物的组成部分,与RNA聚合酶II结合并稳定其与启动子的相互作用,同时参与转录延伸。GTF2F2在基因表达调控中发挥关键作用,其功能异常可能导致转录失调,进而影响细胞正常生理过程。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 GTF2F2基因突变可能导致神经发育障碍,但具体机制尚在研究中。 ClinVar
智力障碍 部分GTF2F2错义突变与智力障碍相关,证据等级为中等。 ClinVar
癌症 GTF2F2在多种癌症中表达异常,但尚无明确致病证据。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.835C>T (p.Arg279Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与神经发育障碍相关
c.1048G>A (p.Asp350Asn) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与智力障碍相关
c.1180C>T (p.Arg394Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,可能引起功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使TFIIF功能丧失,影响转录起始。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

错义突变可能产生异常蛋白,干扰正常TFIIF复合物功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0006367 transcription initiation at RNA polymerase II promoter • GO:0006368 transcription elongation from RNA polymerase II promoter
• GO:0005634 nucleus

相关通路

hsa03022 Basal transcription factors
hsa04068 FoxO signaling pathway
hsa05200 Pathways in cancer

蛋白质功能简介

GTF2F2蛋白是通用转录因子IIF(TFIIF)的β亚基,与α亚基(GTF2F1)形成异二聚体。TFIIF与RNA聚合酶II结合,促进其与启动子DNA的稳定结合,并参与转录起始和延伸过程。GTF2F2蛋白包含一个与RNA聚合酶II相互作用的结构域,以及一个DNA结合结构域。其表达广泛,在多种组织中均有表达。

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