GTF2H2基因|基因功能、疾病关联、突变与转录调控研究
GTF2H2是通用转录因子IIH复合物的核心亚基,参与转录起始和DNA修复,其突变与罕见遗传病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | GTF2H2 |
|---|---|
| 基因全名 | General Transcription Factor IIH Subunit 2 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 5q13.2 |
| NCBI Gene ID | 2966 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2966 |
| Ensembl ID | ENSG00000145779 |
| UniProt ID | Q13888 |
| OMIM ID | 601748 |
| HGNC ID | 4656 |
| 基因别名 | ['BTF2 p44', 'TFIIH p44', 'T-BTFIIH', 'GTF2H2A'] |
基因功能与研究简介
GTF2H2基因编码通用转录因子IIH(TFIIH)复合物的p44亚基。TFIIH是RNA聚合酶II转录起始所必需的多亚基复合物,同时参与核苷酸切除修复(NER)途径。GTF2H2在转录和DNA修复中发挥关键作用,其功能异常可能导致遗传性疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 毛发硫营养不良 | GTF2H2突变导致TFIIH复合物功能异常,影响转录和DNA修复,导致毛发硫营养不良(TTD)等疾病。 | OMIM |
| 着色性干皮病 | GTF2H2突变可能影响NER途径,与着色性干皮病(XP)相关,但证据有限。 | OMIM |
| 癌症 | GTF2H2在多种癌症中表达异常,可能通过影响DNA修复和转录调控参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
| c.100C>T (p.Arg34Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.200delA (p.Asn67ThrfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型突变):导致GTF2H2蛋白功能缺失或降低,影响TFIIH复合物的稳定性或活性,进而影响转录和DNA修复。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明GTF2H2存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):可能通过干扰TFIIH复合物的组装或功能,产生显性负性效应,但具体证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000993 (RNA polymerase II general transcription initiation factor activity) | • GO:0006281 (DNA repair) |
| • GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter) | • GO:0005634 (nucleus) |
相关通路
• hsa03022 (Basal transcription factors)
• hsa03420 (Nucleotide excision repair)
蛋白质功能简介
GTF2H2蛋白(p44)是TFIIH复合物的核心亚基,与p34、p52等亚基相互作用,参与复合物的组装和稳定性。p44具有锌指结构域,可能参与DNA结合和蛋白互作。在转录起始中,TFIIH通过其解旋酶活性打开启动子DNA双链;在NER中,TFIIH参与损伤位点的识别和切除。GTF2H2的突变可能导致TFIIH功能缺陷,引发遗传性疾病。
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