GTF2IRD2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
GTF2IRD2是GTF2I家族成员,参与转录调控和发育过程,与Williams-Beuren综合征相关,并可能影响癌症进展。
基因信息卡
| 基因符号 | GTF2IRD2 |
|---|---|
| 基因全名 | GTF2I repeat domain containing 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7q11.23 |
| NCBI Gene ID | 84163 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84163 |
| Ensembl ID | ENSG00000105974 |
| UniProt ID | Q8N9N2 |
| OMIM ID | 608651 |
| HGNC ID | 18003 |
| 基因别名 | GTF2IRD2A, KIAA0645, WBSCR11 |
基因功能与研究简介
GTF2IRD2(GTF2I repeat domain containing 2)是GTF2I家族成员,位于染色体7q11.23区域,该区域与Williams-Beuren综合征(WBS)相关。GTF2IRD2编码的蛋白质含有多个螺旋-环-螺旋(HLH)结构域,可能参与转录调控和蛋白质-蛋白质相互作用。研究表明,GTF2IRD2在神经发育、肌肉分化和癌症中发挥重要作用。其表达异常与WBS的神经表型相关,并在多种肿瘤中观察到表达改变。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Williams-Beuren综合征 | GTF2IRD2位于WBS关键区域,其单倍剂量不足可能参与神经发育异常和面部特征的形成。 | OMIM |
| 癌症 | GTF2IRD2在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡影响肿瘤进展。 | COSMIC, PubMed |
| 精神分裂症 | 有研究提示GTF2IRD2变异与精神分裂症风险相关,但证据尚不充分。 | PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | Loss of Function |
| c.456_457insA (p.Thr153AsnfsTer5) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | Loss of Function |
| c.789G>A (p.Trp263Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):导致蛋白质功能丧失或显著降低,可能引起单倍剂量不足。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明GTF2IRD2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明GTF2IRD2存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
GTF2IRD2蛋白属于GTF2I家族,含有多个螺旋-环-螺旋结构域,可能参与转录调控和蛋白质相互作用。该蛋白在细胞核中表达,可能调控基因表达。研究表明,GTF2IRD2在神经发育和肌肉分化中发挥作用,其异常表达与WBS和癌症相关。
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