H3-3B基因|组蛋白H3.3功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

H3-3B编码组蛋白H3.3,参与基因转录调控、DNA修复和染色质重塑,其突变与多种肿瘤相关。

基因信息卡

基因符号 H3-3B
基因全名 H3 histone, family 3B
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q25.1
NCBI Gene ID 3021 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3021
Ensembl ID ENSG00000132475
UniProt ID P84243
OMIM ID 601058
HGNC ID 4782
基因别名 H3.3B, H3F3B

基因功能与研究简介

H3-3B基因编码组蛋白H3.3,是组蛋白H3家族的非典型成员。与典型的组蛋白H3.1/H3.2不同,H3.3在转录活跃区域和端粒等异染色质区域富集,参与转录激活、DNA修复和染色质重塑。H3-3B与H3-3A(H3F3A)编码相同的蛋白质,但两者在基因结构和调控上有所不同。H3-3B的突变,特别是K27M和G34R/V突变,已被发现与多种肿瘤相关,如弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)和骨肉瘤。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG) H3-3B K27M突变导致组蛋白H3.3甲基化异常,抑制基因转录,促进肿瘤发生。 已明确致病
骨肉瘤 H3-3B G34R/V突变影响组蛋白修饰和基因表达,与骨肉瘤发生相关。 已明确致病
胶质母细胞瘤 H3-3B G34R/V突变在胶质母细胞瘤中也有报道,但频率较低。 具有较强研究证据
其他肿瘤 H3-3B突变可能与其他肿瘤相关,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
H4细胞系 暂无可靠数据 暂无可靠数据
U2OS细胞系 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293细胞系 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
K27M 错义突变 在DIPG中约80% 功能获得性突变,导致H3K27me3水平降低,基因表达异常
G34R 错义突变 在骨肉瘤中约20% 功能获得性突变,影响H3K36me3修饰,导致基因表达异常
G34V 错义突变 在骨肉瘤中约10% 功能获得性突变,影响H3K36me3修饰,导致基因表达异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明H3-3B突变导致功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

K27M和G34R/V突变具有功能获得性效应,通过影响组蛋白修饰酶活性,改变表观遗传状态。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明H3-3B突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000786 (nucleosome) • GO:0003677 (DNA binding)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006334 (nucleosome assembly)
• GO:0006325 (chromatin organization)

相关通路

hsa05202 (Transcriptional misregulation in cancer)
hsa05200 (Pathways in cancer)
hsa05034 (Alcoholism)

蛋白质功能简介

H3-3B编码的组蛋白H3.3是核小体的核心组分,参与DNA包装和基因表达调控。H3.3在转录活跃区域富集,与转录延伸、DNA修复和端粒维持相关。H3.3的突变(如K27M、G34R/V)通过影响组蛋白修饰酶(如EZH2、SETD2)的活性,导致表观遗传异常,进而促进肿瘤发生。

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