H3C4基因|组蛋白H3.1功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

H3C4编码组蛋白H3.1,是染色质结构和基因表达调控的核心组分,其突变与多种癌症和发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 H3C4
基因全名 H3 clustered histone 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 6p22.2
NCBI Gene ID 8370 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8370
Ensembl ID ENSG00000277775
UniProt ID P68431
OMIM ID 602810
HGNC ID 4764
基因别名 H3.1, HIST1H3D, H3C4

基因功能与研究简介

H3C4(H3 clustered histone 4)编码组蛋白H3.1,是核小体核心组蛋白之一。组蛋白H3.1参与染色质结构的形成,调控基因表达、DNA复制和修复。H3C4基因位于组蛋白基因簇中,其表达通常在细胞周期S期受到调控。H3C4的突变或异常表达与多种肿瘤发生相关,尤其是儿科弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)等。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG) H3C4基因的K27M突变导致组蛋白H3.1的甲基化异常,影响基因表达调控,促进肿瘤发生。 已明确致病
骨肉瘤 H3C4基因的突变或表达异常可能参与骨肉瘤的发生发展,但具体机制尚在研究中。 具有较强研究证据
其他实体瘤 H3C4的异常表达与多种癌症相关,如乳腺癌、肺癌等,但多为潜在关联。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
胸腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HUVEC 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
K27M (c.80A>T) 错义突变 在DIPG中约80% 功能获得(Gain of Function):导致H3K27me3水平降低,影响基因表达调控
G34R (c.100G>A) 错义突变 在骨肉瘤中约3% 功能获得(Gain of Function):影响H3K36me3修饰,导致基因表达异常
V27I (c.79G>A) 错义突变 罕见 功能未知,可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明H3C4存在功能缺失突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

K27M和G34R突变通过改变组蛋白修饰模式,获得异常功能,促进肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明H3C4突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000786 (nucleosome) • GO:0003677 (DNA binding)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0006334 (nucleosome assembly)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

hsa05322 (Systemic lupus erythematosus)
hsa05202 (Transcriptional misregulation in cancer)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

H3C4编码的组蛋白H3.1是核小体的核心成分,由134个氨基酸组成。H3.1的N端尾巴可发生多种翻译后修饰,如甲基化、乙酰化等,这些修饰在基因表达调控中起关键作用。H3.1在DNA复制过程中被整合到新合成的核小体中,确保染色质结构的正确组装。H3C4的突变(如K27M)会导致组蛋白修饰模式改变,进而影响基因表达,促进肿瘤发生。

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