HACL1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
HACL1编码2-羟基酰基-CoA裂解酶,参与过氧化物酶体α-氧化途径,其功能障碍与多种代谢性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | HACL1 |
|---|---|
| 基因全名 | 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3p25.1 |
| NCBI Gene ID | 26061 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26061 |
| Ensembl ID | ENSG00000163823 |
| UniProt ID | Q9UJ83 |
| OMIM ID | 610044 |
| HGNC ID | 21042 |
| 基因别名 | HPCL, 2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase |
基因功能与研究简介
HACL1基因编码2-羟基酰基-CoA裂解酶,该酶定位于过氧化物酶体,参与支链脂肪酸的α-氧化过程。该酶催化2-羟基植烷酰-CoA裂解为植烷醛和甲酰-CoA,是植烷酸代谢的关键步骤。HACL1功能缺陷可导致植烷酸积累,与Refsum病等过氧化物酶体疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Refsum病 | HACL1突变导致2-羟基植烷酰-CoA裂解酶活性降低,植烷酸α-氧化受阻,引起植烷酸在体内积累,导致神经系统和视网膜损伤。 | 已明确致病 |
| 过氧化物酶体生物发生障碍 | HACL1作为过氧化物酶体基质蛋白,其功能异常可能与其他过氧化物酶体蛋白缺陷共同影响代谢,但直接关联证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于RNA测序) |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.457C>T (p.Arg153*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1000G>A (p.Gly334Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变导致截短蛋白,丧失酶活性,引起植烷酸代谢障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003986 (acetyl-CoA C-acyltransferase activity) | • GO:0005777 (peroxisome) |
| • GO:0006631 (fatty acid alpha-oxidation) |
相关通路
• 过氧化物酶体α-氧化(Peroxisomal alpha-oxidation)
蛋白质功能简介
HACL1蛋白由578个氨基酸组成,分子量约63 kDa,定位于过氧化物酶体。该蛋白以同源二聚体形式存在,催化2-羟基脂肪酸的裂解反应,是α-氧化的限速酶。其活性依赖于硫胺素焦磷酸(TPP)和镁离子。