HACL2基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
HACL2编码2-羟基酰基-CoA裂解酶2，参与过氧化物酶体脂肪酸α-氧化，其功能障碍与神经系统疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | HACL2 |
|---|---|
| 基因全名 | 2-hydroxyacyl-CoA lyase 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p36.32 |
| NCBI Gene ID | 55454 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55454 |
| Ensembl ID | ENSG00000142611 |
| UniProt ID | Q9H6Z9 |
| OMIM ID | 617917 |
| HGNC ID | HGNC:28235 |
| 基因别名 | HACL2, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 2, FLJ20509 |
基因功能与研究简介
HACL2基因编码2-羟基酰基-CoA裂解酶2，该酶定位于过氧化物酶体，参与脂肪酸α-氧化过程。HACL2催化2-羟基植烷酰-CoA裂解为甲酰-CoA和降植烷醛，是植烷酸代谢的关键步骤。HACL2功能障碍可导致植烷酸积累，与Refsum病等过氧化物酶体疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Refsum病 | HACL2突变导致2-羟基酰基-CoA裂解酶2活性降低，植烷酸α-氧化受阻，引起植烷酸在体内积累，导致神经系统、视网膜和骨骼等损伤。 | 已明确致病 |
| 过氧化物酶体生物发生障碍 | HACL2作为过氧化物酶体基质蛋白，其功能依赖于过氧化物酶体完整性，过氧化物酶体生物发生障碍可间接影响HACL2功能。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.567_568del (p.Leu190fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
HACL2功能缺失突变导致酶活性降低或丧失，影响脂肪酸α-氧化，导致植烷酸积累。
Gain of Function（功能获得，GOF）
暂无明确证据
Dominant Negative（显性负效应，DN）
暂无明确证据
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003995 (acyl-CoA lyase activity) | • GO:0005777 (peroxisome) |
| • GO:0006631 (fatty acid alpha-oxidation) |
相关通路
• REACT:R-HSA-77289 (Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation)
• REACT:R-HSA-77288 (Peroxisomal Fatty Acid Alpha-Oxidation)
蛋白质功能简介
HACL2蛋白由578个氨基酸组成，分子量约64 kDa，定位于过氧化物酶体。该蛋白属于硫胺素焦磷酸依赖性酶家族，催化2-羟基酰基-CoA的裂解反应。HACL2在植烷酸代谢中起关键作用，其缺陷可导致Refsum病。
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