HAND1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
HAND1是心脏发育和胎盘形成的关键转录因子,其突变与先天性心脏病和胚胎发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | HAND1 |
|---|---|
| 基因全名 | heart and neural crest derivatives expressed 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q33.2 |
| NCBI Gene ID | 9421 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9421 |
| Ensembl ID | ENSG00000113196 |
| UniProt ID | O96004 |
| OMIM ID | 602406 |
| HGNC ID | 4807 |
| 基因别名 | HAND, eHAND, Thing1, bHLHa27 |
基因功能与研究简介
HAND1(heart and neural crest derivatives expressed 1)编码一个碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子,在心脏发育、胎盘形成和神经嵴衍生组织的发育中发挥关键作用。HAND1通过形成同源或异源二聚体,调控下游靶基因的表达,影响细胞增殖、分化和凋亡。HAND1的异常表达或突变与先天性心脏病、胚胎发育异常及某些癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性心脏病 | HAND1突变导致心脏发育异常,可能引起室间隔缺损、法洛四联症等。 | ClinVar, OMIM |
| 胚胎发育异常 | HAND1功能缺失导致胎盘发育不全,胚胎致死。 | OMIM, 小鼠模型 |
| 子宫内膜癌 | HAND1表达异常与子宫内膜癌的发生发展相关。 | COSMIC, 文献 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | HAND1在心脏中高表达,尤其在胚胎期。 |
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | HAND1在胎盘滋养层细胞中高表达。 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | HAND1在骨骼肌中低表达。 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | HAND1在脑组织中低表达。 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| H9c2(大鼠心肌细胞) | 暂无可靠数据 | HAND1表达水平较高。 |
| BeWo(人绒毛膜癌细胞) | 暂无可靠数据 | HAND1表达水平较高。 |
| MCF7(人乳腺癌细胞) | 暂无可靠数据 | HAND1表达水平较低。 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.296G>A (p.Arg99His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响DNA结合能力,导致功能丧失。 |
| c.427C>T (p.Arg143Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失。 |
| c.238_239del (p.Leu80fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
HAND1的错义、无义和移码突变可导致功能丧失,影响心脏和胎盘发育。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明HAND1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型HAND1的功能。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity | • RNA polymerase II-specific |
| • GO:0001228 DNA-binding transcription activator activity | • RNA polymerase II-specific |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0007507 heart development |
| • GO:0001890 placenta development | • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• hsa04550: Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells
• hsa05410: Hypertrophic cardiomyopathy
• hsa05414: Dilated cardiomyopathy
蛋白质功能简介
HAND1蛋白由215个氨基酸组成,包含一个基本的DNA结合结构域和一个螺旋-环-螺旋(HLH)结构域。HAND1通过形成同源二聚体或与E蛋白(如TCF3)形成异源二聚体,结合E-box序列(CANNTG),调控靶基因转录。HAND1在心脏发育中促进心肌细胞分化,在胎盘中调节滋养层细胞增殖和侵袭。HAND1的活性受磷酸化等翻译后修饰调控。