HGD基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

HGD基因编码尿黑酸1,2-双加氧酶,其突变导致黑尿症,是研究酪氨酸代谢和遗传性代谢疾病的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 HGD
基因全名 homogentisate 1,2-dioxygenase
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q13.33
NCBI Gene ID 3081 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3081
Ensembl ID ENSG00000113924
UniProt ID Q93099
OMIM ID 607474
HGNC ID 4890
基因别名 AKU, HGO

基因功能与研究简介

HGD基因编码尿黑酸1,2-双加氧酶(homogentisate 1,2-dioxygenase),该酶是酪氨酸分解代谢途径中的关键酶,催化尿黑酸转化为马来酰乙酰乙酸。HGD基因突变导致酶活性丧失,引起尿黑酸在体内蓄积,进而导致黑尿症(Alkaptonuria),这是一种罕见的常染色体隐性遗传病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
黑尿症(Alkaptonuria) HGD基因突变导致尿黑酸1,2-双加氧酶活性缺失,尿黑酸无法正常代谢,在体内氧化沉积,引起关节、软骨和心脏瓣膜等组织褐变,并导致关节炎和尿黑酸尿。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 高表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
小肠 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.457G>A (p.Gly153Arg) 错义突变 常见于黑尿症患者 导致酶活性丧失
c.481G>A (p.Gly161Arg) 错义突变 常见于黑尿症患者 导致酶活性丧失
c.808C>T (p.Arg270Ter) 无义突变 少见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

HGD基因突变导致尿黑酸1,2-双加氧酶功能丧失,无法催化尿黑酸代谢,是黑尿症的主要分子机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明HGD基因存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明HGD基因突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003994: homogentisate 1 • 2-dioxygenase activity
• GO:0006559: L-phenylalanine catabolic process • GO:0006572: tyrosine catabolic process
• GO:0005829: cytosol

相关通路

Tyrosine metabolism (hsa00350)

蛋白质功能简介

HGD蛋白(UniProt Q93099)由445个氨基酸组成,属于双加氧酶家族,含有Fe2+离子结合位点。该蛋白在肝脏和肾脏中高表达,参与酪氨酸分解代谢。HGD蛋白的晶体结构已被解析,为同源四聚体,每个亚基含有一个非血红素铁离子。

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