HIGD2A基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
HIGD2A编码线粒体呼吸链复合物III的辅助亚基,参与细胞能量代谢,其突变与线粒体疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | HIGD2A |
|---|---|
| 基因全名 | HIG1 hypoxia inducible domain family member 2A |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q35.2 |
| NCBI Gene ID | 192286 ncbi.nlm.nih.gov/gene/192286 |
| Ensembl ID | ENSG00000146085 |
| UniProt ID | Q9Y3C1 |
| OMIM ID | 614559 |
| HGNC ID | 22210 |
| 基因别名 | HIG2A, PTD016 |
基因功能与研究简介
HIGD2A(HIG1 hypoxia inducible domain family member 2A)编码一个线粒体蛋白,是呼吸链复合物III(细胞色素c还原酶)的辅助亚基。该蛋白参与线粒体电子传递链的组装和稳定,对细胞能量代谢至关重要。HIGD2A在多种组织中表达,尤其在心脏和骨骼肌等高能量需求组织中水平较高。研究表明,HIGD2A的突变可能导致线粒体功能障碍,与某些线粒体疾病相关。此外,HIGD2A在低氧条件下表达上调,可能参与细胞对缺氧的适应。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 线粒体复合物III缺乏症 | HIGD2A突变导致复合物III组装异常,影响电子传递和ATP生成,导致能量代谢障碍。 | ClinVar收录致病性变异,OMIM关联 |
| Leigh综合征 | 部分HIGD2A突变与Leigh综合征相关,表现为神经退行性病变。 | OMIM关联,研究证据较强 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于RNA测序) |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1?) | 起始密码子突变 | 罕见 | 可能导致蛋白缺失,功能丧失 |
| c.2T>C (p.Met1?) | 起始密码子突变 | 罕见 | 可能导致蛋白缺失,功能丧失 |
| c.3G>A (p.Met1?) | 起始密码子突变 | 罕见 | 可能导致蛋白缺失,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
HIGD2A突变导致蛋白功能丧失,影响复合物III组装,导致线粒体功能障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005739 (mitochondrion) | • GO:0005750 (mitochondrial respiratory chain complex III) |
| • GO:0006122 (mitochondrial electron transport | • ubiquinol to cytochrome c) |
| • GO:0005747 (mitochondrial respiratory chain complex I) | • GO:0005743 (mitochondrial inner membrane) |
相关通路
• hsa00190 (Oxidative phosphorylation)
• hsa05010 (Alzheimer's disease)
• hsa05012 (Parkinson's disease)
• hsa05014 (Amyotrophic lateral sclerosis)
• hsa05016 (Huntington's disease)
蛋白质功能简介
HIGD2A蛋白是线粒体呼吸链复合物III的辅助亚基,参与复合物的组装和稳定。该蛋白位于线粒体内膜,对电子传递和ATP合成至关重要。HIGD2A在低氧条件下表达上调,可能参与细胞对缺氧的适应。其突变可能导致复合物III功能缺陷,进而引发线粒体疾病。