HMCN1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

HMCN1编码一种细胞外基质蛋白,参与基底膜组装和细胞黏附,与年龄相关性黄斑变性等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 HMCN1
基因全名 Hemicentin 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q25.3
NCBI Gene ID 83872 ncbi.nlm.nih.gov/gene/83872
Ensembl ID ENSG00000143341
UniProt ID Q96RW7
OMIM ID 608548
HGNC ID 20013
基因别名 FIBL-6, FLJ10173, MGC126563

基因功能与研究简介

HMCN1基因编码Hemicentin-1蛋白,属于细胞外基质蛋白家族,包含多个免疫球蛋白样结构域和纤维蛋白样结构域。该蛋白在基底膜组装、细胞黏附以及组织发育中发挥重要作用。HMCN1在多种组织中表达,尤其在视网膜、肾脏和血管中高表达。研究表明HMCN1突变与年龄相关性黄斑变性(AMD)和肾脏疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
年龄相关性黄斑变性 HMCN1基因突变可能影响基底膜完整性,导致视网膜色素上皮细胞功能障碍,参与AMD的发病机制。 较强研究证据
肾脏疾病 HMCN1在肾小球基底膜中表达,突变可能影响肾小球滤过功能,与某些肾脏疾病相关。 潜在关联
癌症 HMCN1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞外基质重塑促进肿瘤进展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
视网膜 暂无可靠数据 高表达
肾脏 暂无可靠数据 高表达
血管 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
视网膜色素上皮细胞 暂无可靠数据 高表达
肾小球内皮细胞 暂无可靠数据 中等表达
血管平滑肌细胞 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2236C>T (p.Arg746Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
c.3340G>A (p.Asp1114Asn) 错义突变 罕见 可能影响蛋白与配体结合
c.4567delC (p.Leu1523Trpfs*13) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能引起功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变或截短突变可能导致蛋白功能丧失,影响基底膜完整性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

错义突变可能产生显性负效应,干扰正常蛋白功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005576 (extracellular region) • GO:0007155 (cell adhesion)
• GO:0005604 (basement membrane) • GO:0005515 (protein binding)

相关通路

ECM-receptor interaction (hsa04512)
Focal adhesion (hsa04510)

蛋白质功能简介

Hemicentin-1是一种分泌性细胞外基质蛋白,包含多个免疫球蛋白样结构域和纤维蛋白样结构域。它参与基底膜组装、细胞黏附以及组织发育。在视网膜、肾脏和血管中高表达,可能通过维持细胞外基质稳态来保护组织功能。

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