HMCN2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

HMCN2编码一种细胞外基质蛋白,参与基底膜结构和细胞黏附,其突变与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 HMCN2
基因全名 Hemicentin 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q34.13
NCBI Gene ID 256158 ncbi.nlm.nih.gov/gene/256158
Ensembl ID ENSG00000148357
UniProt ID Q8NDA8
OMIM ID 614710
HGNC ID 26549
基因别名 FLJ90013, MGC138499

基因功能与研究简介

HMCN2(Hemicentin 2)基因编码一种细胞外基质蛋白,属于hemicentin家族。该蛋白含有多个免疫球蛋白样结构域和纤维蛋白样结构域,参与基底膜的结构维持和细胞黏附过程。HMCN2在多种组织中表达,尤其在眼睛、肾脏和血管中丰富。研究表明HMCN2可能参与细胞迁移、增殖和分化,其异常表达与某些癌症和遗传性疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
年龄相关性黄斑变性(AMD) HMCN2基因变异可能影响基底膜完整性,增加AMD风险。 较强研究证据
肾病综合征 HMCN2在肾小球基底膜中表达,突变可能导致蛋白尿和肾功能异常。 潜在关联
癌症 HMCN2在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞外基质促进肿瘤侵袭和转移。 癌症相关

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肾脏 暂无可靠数据 高表达
眼睛 暂无可靠数据 高表达
血管 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
肾小球内皮细胞 暂无可靠数据 高表达
视网膜色素上皮细胞 暂无可靠数据 高表达
血管平滑肌细胞 暂无可靠数据 中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Ile412Val) SNV 0.01% 可能影响蛋白结构,功能影响未知
c.4567C>T (p.Arg1523Ter) Nonsense 0.001% 导致截短蛋白,可能为Loss of Function
c.7890del (p.Gly2631AlafsTer5) Frameshift 0.0005% 移码突变,导致蛋白功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失):突变导致蛋白功能缺失或降低,如无义突变或移码突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):突变导致蛋白获得新功能或活性增强,目前HMCN2未见明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):突变蛋白干扰正常蛋白功能,目前HMCN2未见明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005576 (extracellular region) • GO:0007155 (cell adhesion)
• GO:0005604 (basement membrane)

相关通路

暂无明确Pathway ID

蛋白质功能简介

HMCN2蛋白是一种分泌型细胞外基质蛋白,含有多个免疫球蛋白样结构域和纤维蛋白样结构域。它参与基底膜的结构组成,通过与整合素等受体相互作用调节细胞黏附、迁移和信号转导。HMCN2在组织发育和稳态维持中发挥重要作用,其异常表达与多种疾病相关。

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