HMHB1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
HMHB1(组织相容性次要抗原HB)是一种参与免疫应答的次要组织相容性抗原,与移植免疫和肿瘤免疫相关。
基因信息卡
| 基因符号 | HMHB1 |
|---|---|
| 基因全名 | histocompatibility (minor) HB-1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q31.2 |
| NCBI Gene ID | 26262 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26262 |
| Ensembl ID | ENSG00000113520 |
| UniProt ID | O14417 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | 17356 |
| 基因别名 | HB-1, FLJ20449 |
基因功能与研究简介
HMHB1(组织相容性次要抗原HB)基因编码一种次要组织相容性抗原,该抗原在造血细胞中表达,并参与T细胞介导的免疫应答。HMHB1在造血干细胞移植中可能作为次要组织相容性抗原,影响移植物抗宿主病(GVHD)的发生。此外,HMHB1在多种肿瘤中表达,可能作为肿瘤相关抗原,参与抗肿瘤免疫。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 移植物抗宿主病(GVHD) | HMHB1编码的次要组织相容性抗原可被T细胞识别,在造血干细胞移植中可能诱发GVHD。 | 较强研究证据 |
| 肿瘤免疫 | HMHB1在多种肿瘤中表达,可能作为肿瘤相关抗原,参与抗肿瘤免疫反应。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 外周血白细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| Jurkat | 暂无可靠数据 | T细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs2071543 | SNP | 未知 | 可能影响HMHB1表达或免疫原性 |
| rs2071544 | SNP | 未知 | 可能影响HMHB1表达或免疫原性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006955 (immune response) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• 暂无明确通路
蛋白质功能简介
HMHB1蛋白是一种次要组织相容性抗原,属于跨膜蛋白,可能在细胞表面呈递抗原肽,被T细胞识别。该蛋白在造血细胞中表达,参与免疫应答。其具体功能尚需进一步研究。