HNRNPDL基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
HNRNPDL编码异质性核糖核蛋白D样蛋白,参与RNA加工和基因表达调控,其突变与肢带型肌营养不良1G型相关。
基因信息卡
| 基因符号 | HNRNPDL |
|---|---|
| 基因全名 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D like |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 4q21.22 |
| NCBI Gene ID | 9985 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9985 |
| Ensembl ID | ENSG00000152795 |
| UniProt ID | O14979 |
| OMIM ID | 607137 |
| HGNC ID | 5037 |
| 基因别名 | HNRPDL, JKTBP, LGMD1G, hnRNPD-like |
基因功能与研究简介
HNRNPDL基因编码异质性核糖核蛋白D样蛋白(hnRNPDL),属于hnRNP家族,参与前体mRNA加工、mRNA稳定性调控及基因表达调控。该蛋白含有两个RNA识别基序(RRM),能够结合富含AU的RNA序列。HNRNPDL在多种组织中表达,尤其在骨骼肌中高表达。HNRNPDL基因突变与常染色体显性遗传的肢带型肌营养不良1G型(LGMD1G)相关,该病表现为进行性肢体近端肌无力。此外,HNRNPDL可能参与肿瘤发生和神经退行性疾病,但证据尚不充分。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肢带型肌营养不良1G型 | HNRNPDL基因突变(如c.1138G>A, p.Asp380Asn)导致蛋白功能异常,影响RNA代谢,进而导致肌纤维变性。 | 已明确致病 |
| 癌症 | HNRNPDL在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控癌基因或抑癌基因的mRNA稳定性影响肿瘤发生发展。 | 潜在关联 |
| 神经退行性疾病 | HNRNPDL可能参与tau蛋白的mRNA加工,与阿尔茨海默病等神经退行性疾病相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 骨骼肌细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心肌细胞 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 神经元 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1138G>A (p.Asp380Asn) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与LGMD1G相关 |
| c.1139A>G (p.Asp380Gly) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与LGMD1G相关 |
| c.1141G>A (p.Asp381Asn) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与LGMD1G相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
HNRNPDL突变可能导致蛋白功能丧失或降低,影响RNA加工,导致疾病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明HNRNPDL突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
HNRNPDL突变可能通过显性负效应干扰正常蛋白功能,导致疾病。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006397 mRNA processing | • GO:0016070 RNA metabolic process |
| • GO:0044822 poly(A) RNA binding |
相关通路
• mRNA surveillance pathway
• RNA transport
• Spliceosome
蛋白质功能简介
HNRNPDL蛋白属于hnRNP家族,含有两个RRM结构域,能够结合RNA,参与mRNA的加工、稳定性和翻译调控。该蛋白在细胞核中主要参与前体mRNA的剪接和输出,在细胞质中可能参与mRNA的降解和翻译调控。HNRNPDL在骨骼肌中高表达,其突变导致LGMD1G,提示其在肌肉发育和维持中的重要作用。