HNRNPDL基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

HNRNPDL编码异质性核糖核蛋白D样蛋白,参与RNA加工和基因表达调控,其突变与肢带型肌营养不良1G型相关。

基因信息卡

基因符号 HNRNPDL
基因全名 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D like
基因类型 protein coding
染色体位置 4q21.22
NCBI Gene ID 9985 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9985
Ensembl ID ENSG00000152795
UniProt ID O14979
OMIM ID 607137
HGNC ID 5037
基因别名 HNRPDL, JKTBP, LGMD1G, hnRNPD-like

基因功能与研究简介

HNRNPDL基因编码异质性核糖核蛋白D样蛋白(hnRNPDL),属于hnRNP家族,参与前体mRNA加工、mRNA稳定性调控及基因表达调控。该蛋白含有两个RNA识别基序(RRM),能够结合富含AU的RNA序列。HNRNPDL在多种组织中表达,尤其在骨骼肌中高表达。HNRNPDL基因突变与常染色体显性遗传的肢带型肌营养不良1G型(LGMD1G)相关,该病表现为进行性肢体近端肌无力。此外,HNRNPDL可能参与肿瘤发生和神经退行性疾病,但证据尚不充分。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肢带型肌营养不良1G型 HNRNPDL基因突变(如c.1138G>A, p.Asp380Asn)导致蛋白功能异常,影响RNA代谢,进而导致肌纤维变性。 已明确致病
癌症 HNRNPDL在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控癌基因或抑癌基因的mRNA稳定性影响肿瘤发生发展。 潜在关联
神经退行性疾病 HNRNPDL可能参与tau蛋白的mRNA加工,与阿尔茨海默病等神经退行性疾病相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
骨骼肌细胞 暂无可靠数据 高表达
心肌细胞 暂无可靠数据 中等表达
神经元 暂无可靠数据 中等表达
HeLa 暂无可靠数据 中等表达
HEK293 暂无可靠数据 中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1138G>A (p.Asp380Asn) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与LGMD1G相关
c.1139A>G (p.Asp380Gly) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与LGMD1G相关
c.1141G>A (p.Asp381Asn) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与LGMD1G相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

HNRNPDL突变可能导致蛋白功能丧失或降低,影响RNA加工,导致疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明HNRNPDL突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

HNRNPDL突变可能通过显性负效应干扰正常蛋白功能,导致疾病。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006397 mRNA processing • GO:0016070 RNA metabolic process
• GO:0044822 poly(A) RNA binding

相关通路

mRNA surveillance pathway
RNA transport
Spliceosome

蛋白质功能简介

HNRNPDL蛋白属于hnRNP家族,含有两个RRM结构域,能够结合RNA,参与mRNA的加工、稳定性和翻译调控。该蛋白在细胞核中主要参与前体mRNA的剪接和输出,在细胞质中可能参与mRNA的降解和翻译调控。HNRNPDL在骨骼肌中高表达,其突变导致LGMD1G,提示其在肌肉发育和维持中的重要作用。

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