HNRNPF基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

HNRNPF编码异质性核糖核蛋白F,参与RNA加工与基因表达调控,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 HNRNPF
基因全名 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q11.21
NCBI Gene ID 3185 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3185
Ensembl ID ENSG00000169813
UniProt ID P52597
OMIM ID 601037
HGNC ID 5037
基因别名 hnRNP F, HNRPF, mcs3-1

基因功能与研究简介

HNRNPF基因编码异质性核糖核蛋白F(hnRNP F),属于hnRNP家族,参与前体mRNA的加工、转运和代谢调控。该蛋白包含三个RNA识别基序(RRM),能够结合富含G的RNA序列,在基因表达调控中发挥重要作用。HNRNPF在多种组织中表达,尤其在脑、心脏和骨骼肌中高表达。研究表明,HNRNPF的异常表达与多种肿瘤和神经系统疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 HNRNPF在结直肠癌中高表达,可能通过调控基因表达促进肿瘤进展。 较强研究证据
肝细胞癌 HNRNPF在肝细胞癌中表达上调,与不良预后相关,可能参与肿瘤侵袭和转移。 较强研究证据
胶质瘤 HNRNPF在胶质瘤中表达异常,可能影响肿瘤细胞增殖和凋亡。 潜在关联
肌萎缩侧索硬化 HNRNPF可能参与ALS的病理过程,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 高表达
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.456C>T (p.Ser152Leu) 错义突变 罕见 可能影响RNA结合能力
c.789del (p.Glu264fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致蛋白功能丧失或降低的突变,如移码突变和截短突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

导致蛋白获得新功能或活性增强的突变,目前暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

突变蛋白干扰正常蛋白功能的突变,目前暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• RNA binding (GO:0003723) • mRNA processing (GO:0006397)
• nucleus (GO:0005634) • nucleoplasm (GO:0005654)
• regulation of alternative mRNA splicing • via spliceosome (GO:0000381)

相关通路

mRNA Splicing - Major Pathway (R-HSA-72163)
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA (R-HSA-72203)

蛋白质功能简介

HNRNPF蛋白属于异质性核糖核蛋白家族,包含三个RNA识别基序(RRM),能够结合富含G的RNA序列。该蛋白参与前体mRNA的加工、转运和代谢调控,在基因表达调控中发挥重要作用。HNRNPF在多种组织中表达,尤其在脑、心脏和骨骼肌中高表达。研究表明,HNRNPF的异常表达与多种肿瘤和神经系统疾病相关。

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