HNRNPK基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

HNRNPK编码异质性核糖核蛋白K,参与RNA代谢、基因表达调控和DNA损伤应答,与多种癌症及神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 HNRNPK
基因全名 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q21.32
NCBI Gene ID 3190 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3190
Ensembl ID ENSG00000165119
UniProt ID Q07244
OMIM ID 600712
HGNC ID 5044
基因别名 HNRPK; TUNP; CSBP; dC1; FLJ41122

基因功能与研究简介

HNRNPK基因编码异质性核糖核蛋白K(hnRNP K),该蛋白属于hnRNP家族,广泛参与RNA代谢的多个方面,包括mRNA的加工、转运、翻译和稳定性调控。hnRNP K还作为转录因子和信号转导分子,参与基因表达调控、细胞增殖、分化和凋亡等过程。此外,hnRNP K在DNA损伤应答中发挥作用,与基因组稳定性维持相关。HNRNPK基因的异常表达或突变与多种疾病相关,包括癌症和神经发育障碍。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 HNRNPK过表达促进肿瘤细胞增殖和转移,通过调控多种癌基因和抑癌基因的表达。 较强研究证据
结直肠癌 HNRNPK高表达与肿瘤分期和不良预后相关,可能通过影响Wnt/β-catenin信号通路。 较强研究证据
乳腺癌 HNRNPK在乳腺癌中表达上调,与肿瘤侵袭性和化疗耐药相关。 较强研究证据
肺癌 HNRNPK表达异常与非小细胞肺癌的发生发展相关,可能通过调控EMT过程。 较强研究证据
神经发育障碍 HNRNPK基因突变与神经发育障碍相关,包括智力障碍和自闭症谱系障碍。 已明确致病
Au-Kline综合征 HNRNPK基因功能缺失突变导致Au-Kline综合征,表现为智力障碍、发育迟缓和面部畸形。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1000C>T (p.Arg334Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,具体机制待研究
c.1500_1501insA (p.Gly501ArgfsTer3) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,如无义突变、移码突变,导致蛋白截短或降解,影响hnRNP K的正常功能,与神经发育障碍相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得突变,可能增强hnRNP K的致癌活性,但具体突变尚不明确。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,可能干扰野生型蛋白的功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0006397 mRNA processing
• GO:0006417 regulation of translation • GO:0006974 DNA damage response
• GO:0008283 cell proliferation • GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

相关通路

hsa03018 RNA degradation
hsa05166 Human T-cell leukemia virus 1 infection
hsa05200 Pathways in cancer

蛋白质功能简介

hnRNP K蛋白由463个氨基酸组成,包含三个KH结构域,负责RNA结合。该蛋白在细胞核和细胞质中均有分布,参与mRNA的加工、转运和翻译调控。hnRNP K还作为转录共调节因子,与多种转录因子相互作用,调控基因表达。此外,hnRNP K参与DNA损伤应答,通过调节p53等关键蛋白的活性影响细胞周期和凋亡。

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