HNRNPU基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

HNRNPU编码核内不均一核糖核蛋白U,参与RNA加工、染色质组织和基因表达调控,其突变与神经发育障碍和癫痫相关。

基因信息卡

基因符号 HNRNPU
基因全名 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q44
NCBI Gene ID 3192 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3192
Ensembl ID ENSG00000153187
UniProt ID Q00839
OMIM ID 602869
HGNC ID 5048
基因别名 HNRPU, SAF-A, U21.1, hnRNP U

基因功能与研究简介

HNRNPU基因编码核内不均一核糖核蛋白U(hnRNP U),是一种丰富的核蛋白,属于hnRNP家族。该蛋白参与多种细胞过程,包括前体mRNA加工、RNA稳定性调节、染色质组织、基因表达调控以及DNA损伤应答。HNRNPU通过结合RNA和DNA,在转录调控、剪接和核内RNA保留中发挥作用。此外,HNRNPU是染色质相关蛋白,参与有丝分裂期间染色体的正确分离。HNRNPU基因突变与多种神经发育障碍相关,包括早发性癫痫、智力障碍和自闭症谱系障碍。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
早发性癫痫性脑病 HNRNPU基因突变导致单倍剂量不足,影响神经元发育和功能,引起癫痫和智力障碍。 已明确致病
智力障碍 HNRNPU基因突变与常染色体显性智力障碍相关,机制可能涉及神经元基因表达调控异常。 已明确致病
自闭症谱系障碍 HNRNPU基因突变在自闭症患者中被发现,可能通过影响突触相关基因表达导致疾病。 较强研究证据
小头畸形 部分HNRNPU突变患者表现为小头畸形,可能与神经发育异常有关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
U87 暂无可靠数据 胶质母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.739C>T (p.Arg247Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1264C>T (p.Arg422Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1963G>A (p.Gly655Arg) 错义突变 罕见 可能为Loss of Function
c.2389C>T (p.Arg797Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数HNRNPU致病突变导致单倍剂量不足,即功能丧失。无义突变和移码突变导致提前终止密码子,可能触发无义介导的mRNA降解,导致蛋白表达减少。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明HNRNPU突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明HNRNPU突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006397 mRNA processing • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0005654 nucleoplasm
• GO:0000790 nuclear chromatin

相关通路

hsa03040 Spliceosome
hsa03018 RNA degradation
hsa05034 Alcoholism

蛋白质功能简介

HNRNPU蛋白(UniProt Q00839)是一种分子量约为120 kDa的核蛋白,属于hnRNP家族。该蛋白包含一个N端DNA结合域(SAF-box),一个中间RNA结合域(RGG盒),以及一个C端富含酸性氨基酸的区域。HNRNPU参与前体mRNA的加工、RNA转运和稳定性调控,同时作为染色质相关蛋白,在基因表达调控和DNA损伤应答中发挥作用。HNRNPU通过与多种RNA和DNA相互作用,参与转录调控、剪接和核内RNA保留。此外,HNRNPU在有丝分裂期间与染色体结合,确保染色体正确分离。

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