HOXB1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
HOXB1是HOX基因家族成员,在胚胎发育中调控体节和神经嵴细胞分化,其突变与先天性面神经麻痹和听力损失相关。
基因信息卡
| 基因符号 | HOXB1 |
|---|---|
| 基因全名 | homeobox B1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q21.3 |
| NCBI Gene ID | 3211 ncbi.nlm.nih.gov/gene/3211 |
| Ensembl ID | ENSG00000120068 |
| UniProt ID | P14653 |
| OMIM ID | 142968 |
| HGNC ID | 4980 |
| 基因别名 | HOX2, HOX2I, Hox-2.7 |
基因功能与研究简介
HOXB1(homeobox B1)是HOX基因家族的一员,编码含有同源异型结构域的转录因子。HOX基因在胚胎发育中起着关键作用,调控前后轴模式形成和器官发生。HOXB1在神经嵴细胞、后脑和耳囊中表达,参与面神经核的发育和听觉系统的形成。HOXB1的突变可导致先天性面神经麻痹和听力损失,表现为面部表情肌无力、外耳畸形等。此外,HOXB1在多种癌症中异常表达,可能参与肿瘤发生和发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性面神经麻痹伴听力损失 | HOXB1基因突变导致面神经核发育异常,影响面神经支配的肌肉,同时影响内耳结构,导致听力损失。 | 已明确致病 |
| 多发性先天性畸形 | HOXB1突变可能与其他基因共同作用,导致多系统发育异常,但具体机制尚需进一步研究。 | 潜在关联 |
| 癌症 | HOXB1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和分化参与肿瘤发生,但具体作用尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 耳 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胚胎组织 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.421C>T (p.Arg141Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白质截短,功能丧失 |
| c.83G>A (p.Trp28Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白质截短,功能丧失 |
| c.346A>G (p.Thr116Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白质功能,但具体影响需进一步研究 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型突变):导致HOXB1蛋白功能部分或完全丧失,常见于无义突变或移码突变,与先天性面神经麻痹相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明HOXB1存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明HOXB1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0007275 multicellular organism development |
| • GO:0048704 embryonic skeletal system morphogenesis |
相关通路
• Developmental Biology (Reactome: R-HSA-1266738)
• HOX genes in development (KEGG: hsa04340)
蛋白质功能简介
HOXB1蛋白属于同源异型盒转录因子家族,包含一个高度保守的DNA结合结构域(homeodomain),能够结合特定的DNA序列,调控下游靶基因的表达。在胚胎发育中,HOXB1参与后脑的节段性模式形成,特别是菱脑原节(rhombomere)4的发育,进而影响面神经核和听觉系统的形成。HOXB1的突变可导致蛋白质功能丧失,引起先天性面神经麻痹和听力损失。此外,HOXB1在成体组织中表达水平较低,但在某些肿瘤中可能异常表达,提示其在肿瘤发生中可能具有潜在作用。
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